甘蔗割手密种和热带种基因差异表达的基因芯片和Solexa高通量技术的比较分析

来源 :热带作物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：jiu_yue9

【摘要】

：

分别采用甘蔗表达谱芯片和Solexa技术，对甘蔗热带种和割手密种基因表达谱进行分析。结果表明：基因芯片技术筛选得到1245个差异表达基因：Solexa技术分别在热带种和割手密种中得到

【作者】

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侯平王英高和琼庄南生

【机构】

：

海南大学热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室

【出处】

：

热带作物学报

【发表日期】

：

2013年6期

【关键词】

：

甘蔗差异表达基因芯片 Solexa技术

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分别采用甘蔗表达谱芯片和Solexa技术，对甘蔗热带种和割手密种基因表达谱进行分析。结果表明：基因芯片技术筛选得到1245个差异表达基因：Solexa技术分别在热带种和割手密种中得到42913194个和39363668个初始tag，从中获得143121和112281个高质量测序标签（clean tags），对应的标签种数（distinct clean tags）分别为25164和20349，未知序列（unknown clean tags）分别为117957和91932，其中差异表达基因有1432个。基因芯

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