基于叶绿体DNA序列的多基原黄精分子鉴定

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目的:通过分析rpl20-rps12、trnL-trnF及psbA-trnH序列变异特点,评价其对3种不同基原黄精的鉴定能力.方法:分别提取3种基原黄精总DNA,以rpl20-rps12、trnL-trnF及psbA-trnH引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和测序.采用MEGA 5软件寻找其特异位点,计算样品K2-P(Kimura 2-parameter)遗传距离,并构建邻接(neighbor-joining,NJ)系统聚类树.结果:rpl20-rps12、trnL-trnF及psbA-trnH序列长度分别为722~737、293、457~531 bp,简约信息位点占比分别为0.4%、1.0%和2.4%.rpl20-rps12和psbA-trnH序列中种内最大遗传距离均小于种间最小遗传距离.基于3个序列构建的NJ树显示,3种基原黄精都表现出良好单系性,能明显区分.结论:从序列特点和种内、种间变异性综合分析,rpl20-rps12序列更适宜黄精的基原鉴定.
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