【摘 要】
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在中药废水生物活性污泥群落DGGE解析过程中,为了探讨16S rDNA通用引物的扩增效率和对污泥细菌群落的表征能力,选用包括简并性引物在内的11对通用引物扩增16S rDNA序列的4个
【机 构】
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哈尔滨工业大学城市水资源与水环境国家重点实验室; 哈尔滨师范大学生命科学与技术学院;
【基金项目】
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国家自然科学基金重点项目(50638020);国家自然科学基金青年基金项目(50908062);中国博士后科学基金项目(20090450983);黑龙江省博士后资助经费项目(LBH-Z08197);黑龙江省教育厅科学技术研究项目(11551141);哈尔滨师范大学青年学术骨干项目(KGB200807)
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在中药废水生物活性污泥群落DGGE解析过程中,为了探讨16S rDNA通用引物的扩增效率和对污泥细菌群落的表征能力,选用包括简并性引物在内的11对通用引物扩增16S rDNA序列的4个可变区,并应用DGGE图谱评价不同引物的扩增效率和微生物种群多样性.结果表明,采用不同引物对进行DGGE分析时,微生物种群多样性存在着显著的差异,其中V3和V6～V8可变区分辨率较高,图谱中条带丰富,多样性较好,适合分析中药废水生物活性污泥群落的结构,而V1～V3和V3～V5可变区DGGE图谱多样性较差.基于此,采用16S rDNA的V3和V6～V8区引物调查中药废水生物活性污泥群落都是适宜的,若考虑到序列携带更多的分类信息,建议应用V6～V8可变区引物(B968F/B1401R);为获得更高的群落多样性信息,建议将简并和通用引物扩增的V3区PCR产物等量混合后进行DGGE分析.
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