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大量研究显示，细菌与真核生物中的许多氨酰-tRNA合成酶（aaRs）在一些细菌与真核生物中的基因进化机制与模式、氨酰化途径和结构与功能的进化模式等方面往往有着明显的差异。通过对这些差异的深入研究，对于理解蛋白质的结构与功能的进化将是非常有帮助的。虽然造成这些差异的机制目前仍不清楚，但是，所有的这些差异似乎提示，在细菌与真核生物的一些基本生命活动过程中的某些方面，可能还存在着目前尚未被人们所认识到的较大差异。