苍术根茎转录组比较分析及倍半萜生物合成基因发掘

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为了研究苍术根茎不同生长发育时期转录水平差异,发掘其中倍半萜类化合物生物合成途径相关酶编码基因,对3个不同生长发育时期苍术根茎进行了转录组测序及比较分析。利用Illumina NovaSeq 6000技术对生长期(SZ)、开花期(KH)和采收期(CS)的苍术根茎进行了cDNA文库测序。共得到388 201 748条clean reads,比较SZ vs KH、KH vs CS、SZ vs CS,分别鉴定到16 925、8 616、13 702条差异表达基因(DEGs),注释到53条可能参与到倍半萜生物合成途径中的基因,其中甲羟戊酸(MVA)途径上注释到可能编码6种酶的9条基因,2-C-甲基-D-赤藓糖醇-4-磷酸(MEP)途径中注释到可能编码7种酶的15条基因,倍半萜和三萜生物合成代谢通路中注释到29条基因。通过基因共表达网络分析(WGCNA)得到与生长期、开花期和采收期相关的倍半萜类化合物生物合成关键基因分别有12、1、1条,再联合共表达网络图挖掘到多个倍半萜类化合物合成候选基因。该研究为探索研究苍术根茎中倍半萜类化合物的生物合成途径并解析其表达调控与倍半萜类物质累积的分子机制奠定了基础。
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