【摘 要】
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目的 预测刚地弓形虫表面抗原糖蛋白相关序列(Toxoplasma gondii surface antigen glycoprotein 1-related sequences) SRS47D的结构、修饰位点和免疫原性. 方法 利用在线软
【机 构】
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中国农业科学院上海兽医研究所,农业部动物产品质量安全生物性危害因子风险评估实验室(上海),农业部动物寄生虫学重点实验室,上海200241
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目的 预测刚地弓形虫表面抗原糖蛋白相关序列(Toxoplasma gondii surface antigen glycoprotein 1-related sequences) SRS47D的结构、修饰位点和免疫原性. 方法 利用在线软件ProtParam、ProtScale、SignalP分别预测SRS47D的理化参数、亲/疏水性、信号肽;利用SOPMA、ESPriit 3.0、Bcepred预测SRS47D蛋白的二级结构及表面可极性,利用COLIS、TMHMM预测其卷曲螺旋和跨膜结构域;利用KinasePhos、NetOGlyc、NetNGlyc、NetCGlyc、和NetPhos分析其修饰位点;利用SWISS-MODEL、VAST预测其三级结构及其与SAG1三级结构的差异,利用ABCpred和Syfpeithi预测其B、T细胞表位. 结果 SRS47D蛋白含有376个氨基酸残基,分子式为C1745H2797N469O587S17,相对分子质量约为40×103,理论等电点为4.96;疏水值为71.60,总平均亲水性为-0.405.在SRS47D蛋白的二级结构中,α-螺旋、β-折叠、β-转角、无规则卷曲所占比例分别为23.14％、19.68％、2.39％和54.79％.SRS47D蛋白具有信号肽序列,无跨膜结构区,具有18个亲水区域(临界值为1.9)、8个柔性区域(临界值为2)和17个表面可及性区域(临界值为1.9).SRS47D蛋白翻译后修饰位点中包含两个糖原合成酶激酶位点和两个O-GlcNAc糖基化位点,无N-GlcNAc和C-Glc-NAc糖基化位点.与弓形虫表面抗原糖蛋白1(SAG1)蛋白三级结构比对,SRS47D在β折叠处存在重叠.ABCpred和Syfpeith预测SRS47D蛋白有24个限制性CTL细胞表位、13个限制性Th细胞表位和10个B细胞抗原表位. 结论 SRS47D蛋白含丰富的B、T细胞表位,免疫原性好,可能成为弓形虫病疫苗候选分子.
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