龙须菜线粒体基因组研究

来源 :辽宁省气象局、丹东市气象局、中国海洋湖沼学会气象分会、中国海洋湖沼学 会潮汐海平面专业委员会、中国海洋湖沼学会计算物理专 | 被引量 : 0次 | 上传用户:eduaskbj
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  龙须菜(Gracilariopsis lemaneiformis)在琼胶生产、提供鲍饵料等方面具有重要的经济价值.尤其是在我国,龙须菜已成为我国继海带和紫菜之后的第三大海藻栽培业.本研究通过全基因组测序技术获得了龙须菜线粒体基因组,结果显示,龙须菜线粒体DNA为双链环状结构,序列长度为25885bp,A+T含量72.5%编码46个基因,其中24个蛋白编码基因,2个核糖体RNA基因(rRNA),20个转运RNA基因(tRNA),与已发布的4种江蓠科海藻线粒体基因组的基因数目和排列方式几乎完全一致,具有很好的共线性关系;但龙须菜在nad6和sdhB基因之间插入了独有的ORF60基因,同时,基因间隔区存在一段稳定的茎环结构,可能与线粒体基因组的转录和复制有关.2个龙须菜诱变品系的线粒体基因组长度及基因排列顺序与野生龙须菜完全一致,仅存在9个位点的碱基变异,且全部位于基因编码区,其中8个在蛋白编码基因上,1个在tRNA上,均没有影响基因的读码方式;变异位点中有4个为同义突变,这表明诱变并没有导致龙须菜线粒体基因组发生大规模的重排或者明显的插入缺失.
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