【摘 要】
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本研究于2009-2011年间从中国东部16个猪场中分离到7株PCV2,并测定了其全长序列.为分析其基因型和亚型归属,我们将其ORF2序列与从NCBI中获得的381条PCV2ORF2序列一起比对后,按照欧洲PCVD委员会推荐的邻接法对其构建系统进化树.结果显示,本研究所分离到的两株PCV2(HYan09与NBiaol0)与国内外历年分离的另外10株PCV2(10AH、10GX、09HaiN1、09
【机 构】
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浙江大学,农业部动物病毒学重点实验室,浙江杭州310058;浙江同点生物科技有限公司,浙江杭州310030
【出 处】
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2013国际猪繁殖与呼吸综合征学术研讨会
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本研究于2009-2011年间从中国东部16个猪场中分离到7株PCV2,并测定了其全长序列.为分析其基因型和亚型归属,我们将其ORF2序列与从NCBI中获得的381条PCV2ORF2序列一起比对后,按照欧洲PCVD委员会推荐的邻接法对其构建系统进化树.结果显示,本研究所分离到的两株PCV2(HYan09与NBiaol0)与国内外历年分离的另外10株PCV2(10AH、10GX、09HaiN1、09HaiN2、AY035820、INDON07-P09-07-07Lg2、INDON01-P009-10-01、THKUL 16、THKUF49、01NPl)具有PCV2b基因型标签序列,但在构建的系统进化树中却与PCV2a共用一个节点(node),且不属于该基因型下任何已定义亚型.遗传距离计算表明,这12株PCV2达不到成立一个新基因型的标准,但超过了已知所有PCV2基因亚型间的遗传距离.我们进一步根据PCV2分离时间、分离地点和遗传距离,筛选了45条PCVD委员会已经明确定义基因亚型归属的PCV2序列和上述12条PCV2序列一起构成新的序列集,利用PAUP、MrMTgui、MODELTEST软件组合基于AIC信息准则计算了这一新序列集的最优进化模型及相关进化参数,并借助邻接法、最大简约法、极大似然法、贝叶斯法对这一新序列集构建了系统进化树,得到了与上述分析一致的结果.将这些毒株序列利用cluster软件比对后,发现其ORF2的175-176位点有特异碱基序列AA,对应的特异氨基酸为赖氨酸,411和417位点有特异碱基T.对分离株ORF2全长序列的重组分析表明,上述12株PCV2并非重组病毒.综上,我们将这12株PCV2归为PCV2a新亚型并命名为PCV2a/2F.另外5株PCV2(YHang09、TZhoull、HNing09、YWu09、XShan09)则属于PCV2b/1C.新亚型的分离与鉴定丰富了PCV2亚型种类.
其他文献
引言 猪繁殖与呼吸综合症病毒的非结构蛋白对于病毒的复制具有很重要的作用.目前Nsp7的结构及其在PRRSV复制周期中的作用尚未明确,研究显示Nsp7抗体产生时间早,抗体水平高,持续时间长,表明Nsp7与机体免疫应答关系较为密切.由于Nsp7基因在Nsp中相对保守,不同病毒株之间差异变化较小,因此适于作为检测抗原检测不同病毒株的抗体水本研究.本研究将通过对Nsp7进行突变和缺失来探索Nsp7蛋白质的
PRRS引起猪繁殖与呼吸系统疾病,是给养猪业带来重要经济损失的猪病.猪繁殖与呼吸系统综合征病毒(PRRSV)的复制酶非结构蛋白2(Nsp2)被认为是PRRSV基因组中最易变区域.本综述讨论了PRRSV Nsp2的分子生物学特性和免疫学功能及它与病毒致病性的关系,阐述了Nsp2在细胞和组织嗜性,PRRSV复制增殖、变异和致病性中的作用,PRRSV Nsp2基因的遗传变异明显,如点突变、核苷酸的插入或
目的 猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV),是属于动脉炎病毒属有囊膜的单股正链RNA病毒.病毒细胞受体是介导PRRSV对宿主细胞形成感染的关键因素.目前,已经从PRRSV易感细胞中发现多个蛋白与病毒的结构蛋白或RNA存在相互作用.例如,PAM细胞上的硫酸乙酰肝素蛋白多糖-类肝素分子能够结合PRRSV的M蛋白;唾液酸粘附素通过唾液酸可以与M/GP5复合物结合;CD163与GP2a和GP4蛋白存在相互
猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)是2006年我国猪群发生"猪高热病"的重要病原之一，迄今其已成为我国乃至世界养猪业头号病毒性疫病，严重危害养猪业。为全面了解PRRSV在安徽省的流行情况以及遗传变异规律，本研究对从2011年1月至2013年1月期间，安徽地区持续高热病猪体内的PRRSV流行株进行了分离、鉴定和基因克隆；并分析了PRRSV流行株之间及其与国内外己发表的其它毒株间的遗传变异关系，并建
背景 猪圆环病毒2型(PCV2)是断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)的主要病原,该病给养猪业带来巨大的经济损失.PCV2 Cap蛋白上保守序列97RIRKVKV103可能是该病毒的受体结合位点,然而Cap蛋白的结构显示该序列位于病毒粒子的内部,因此该序列作为受体结合位点的功能受到质疑.该序列在PCV2毒株之间高度保守,可能具有重要功能.本研究旨在阐明该保守序列在PCV2复制过程中的功能.
Obiective:Previously,we generated a monoclonal anti-idiotypic antibody (designated Mab2-5G2) that is specific for the syngenic mouse antibodies against PRRSV GP5,binds Marc-145 cells and porcine alveo
引言 猪繁殖与呼吸障碍综合征(PRRS)是由PRRS病毒(PRRSV)引起的一种以妊娠母猪严重繁殖障碍以及仔猪的呼吸道症状和高死亡率为特征的高度接触性传染病.为了更好的了解广东地区PRRS病毒分子流行病学情况,在2007到201 1年间从267个广东养殖场中采集到3199份疑似病料,对其中51株阳性样品并进行了ORF5基因序列分析.
引言 猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)被普遍视为最严重的疾病之一.它的病原体,猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)不仅会导致母猪繁殖障碍,也会引起所有年龄段猪的呼吸问题.自从2006爆发的高致病性PRRS疫情以来,几乎所有在中国和越南,2006年的分离的PRRSV和2009年再次出现的PRRSV,都属于北美基因型.此外,欧洲基因型PRRSV也被报道.因此,两个基因型的共存为新病毒的产生提供了最佳条
本研究的目的 在于确定猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)是否也在杂交野猪群中流行.我们于2008-2009年期间对中国的杂交野猪进行了PRRSV的血清学调查.从山东省未免疫PRRSV疫苗的杂交野猪群中收集613份血样,其中167份(27.2％)是PRRSV阳性,从中分离的两株PRRSV(TAYZ和ZCYZ)用MARC-145细胞进行蚀斑纯化,测序并进行动物实验.试验结果显示,TAYZ株和ZCYZ
分别设计两对区分经典株与变异株的PRRSV特异性引物,对2012年本实验室收集到的来自6省28个免疫PRRS弱毒疫苗猪场的271份临床送检样品进行RT-PCR检测.PRRSV的检出率为29.52％(80/271),其中变异株的检出率为25.83％ (70/271),经典株的检出率为13.65％ (37/271),27份样品中可以PRRSV变异株和经典株的同时检出率为10％ (27/271).对临床