小鼠诱导多能干细胞全基因组拷贝数变异分析揭示了多能性因子对基因组完整性的剂量效应

来源 :遗传学与表观遗传学前沿暨第三届中国青年遗传学家论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jusso
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  诱导多能干细胞(iPS),源自体细胞的重编程,在临床医学上有巨大的潜在应用价值.然而值得注意的是最新研究表明体细胞重编程形成诱导iPS的过程中会诱导基因组拷贝数变异(CNV)形成.而CNV是人类疾病非常重要的一个致病因素.目前还不清楚基因组的不稳定是否与重编程方法和/或者供体细胞的遗传背景相关.另外,全基因CNV分析在技术上存在缺陷,所得CNV数据需要谨慎分析.为了研究体细胞重编程过程中可能的CNV不稳定,我们对来自同一供体细胞41例小鼠iPSCs进行全基因组分析.同一供体细胞的应用可以排除供体细胞遗传背景对iPS细胞基因组完整性的影响.不同组合和不同剂量的重编程因子的使用被用于研究诱导方法对iPS基因组完整性的影响.应用高分辨率的比较基因组杂交技术在41例iPSCs中共检测到63个CNVs.有趣的是,研究发现CNV数目与经典重编程因子的剂量呈负相关.而且,相比于经典重编程因子,使用高效工程因子诱导的iPS检测到更少的CNVs.我们研究认为重编程过程中,充分的重编程动力可以保护iPS细胞基因组的完整性.
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