马铃薯孤雌生殖诱导群体病毒病抗性遗传分析

来源 :中国植物病理学会2021年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mimidong
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马铃薯是我国主要主粮作物,其种质资源丰富,在自然界中以二倍体至六倍体的形式普遍存在。病毒病是马铃薯主要病害之一,花叶是马铃薯病毒病的重要表现症状。马铃薯X病毒(Potato virus X,PVX)、马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)、马铃薯S病毒(Potato virus S,PVS)、马铃薯A病毒(Potato virus A,PVA)、马铃薯奥古巴花叶病毒(Potato aucuba mosaic virus,PAMV)等单一或复合侵染均能引起花叶病。本研究对我国西南地区主栽品种合作88的560个孤雌生殖诱导群体[二倍体(2n=2X=24)145份,三倍体(2n=3X=36) 197份,四倍体(2n=4X=48) 218份]的花叶病进行病害分级调查。结果表明:二倍体和三倍体(P=0.0015<0.05)、三倍体和四倍体(P=0.0004<0.05)之间发病情况差异显著。基于BSA方法,通过二代测序(20X)并Mapping至二倍体RH参考基因组,Variant Detection及过滤,在各个混池全基因组水平挖掘到高质量的差异SNPs 12 021个,通过GWAS进一步分析发现抗性SNPs主要富集于染色体Chr 9-2的18~20Mb,以及染色体Chr 12-2的46~49Mb区域内。下一步将利用ELISA确定病毒类型并开展合作88中抗性基因精细定位和克隆相关工作。
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