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随着全基因组测序技术的发展和测序成本的下降,利用高密度分子标记,在基因组水平上预测动植物的遗传效应已经得到应用。传统的水稻品种选育受季节、发育时期限制,效率较低;而利用高通量测序技术获得杂交水稻的标记信息,进而在全基因组上预测不同品种水稻的遗传效应,成本则相对低廉得多,而且效率非常高。