【摘 要】
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以低施氮肥条件下种植的16个甘蔗品种茎基部的内生细菌为研究对象,探讨甘蔗拔节期(伸长期)末期茎部细菌群落多样性,揭示内生细菌群落结构在甘蔗关键发育时期的特征.通过罗氏454高通量测序获得内生细菌16S rRNA片段,然后进行生物信息学分析.测序获得总序列数166728条,利用uclust软件以16S rRNA基因序列相似度大于97％作为相同的操作分类单元(OTU),OTU的总数是1025个.16个
【机 构】
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广西农业科学院微生物研究所,南宁530007 广西农业科学院甘蔗研究所,南宁530007
【出 处】
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第八届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会
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以低施氮肥条件下种植的16个甘蔗品种茎基部的内生细菌为研究对象,探讨甘蔗拔节期(伸长期)末期茎部细菌群落多样性,揭示内生细菌群落结构在甘蔗关键发育时期的特征.通过罗氏454高通量测序获得内生细菌16S rRNA片段,然后进行生物信息学分析.测序获得总序列数166728条,利用uclust软件以16S rRNA基因序列相似度大于97％作为相同的操作分类单元(OTU),OTU的总数是1025个.16个不同甘蔗样品中Chao1指数为62-96,Shanno多样性指数为1.8-2.2,不同品种间内生细菌数量和种类存在一定差异,但总体上相似度比较高.甘蔗茎基部内生细菌群落主要包括芽孢菌(Bacillus)、乳酸杆菌(Lactococcus)和假单胞菌(Pseudomonas)3大类细菌,其中Bacillus为绝对优势类群,占78.41％.所有供试16个甘蔗品种在拔节期这一产量形成的重要时期均拥有Sphingobacterium faecium,Bacillus pumilus,Bacillus stratosphericus,Bacillus circulans和Pseudomonas fragi等内生细菌,而大部这些类群的细菌均已被研究证明具有联合固氮、生防等重要生态功能.
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