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为进一步开展碱茅属植物种质资源遗传多样性的研究,以朝鲜碱茅(Puccinellia chinampoensis)为材料,通过单因子试验对ISSR-PCR反应进行了优化。确立了最佳的PCR反应体系:在20uL反应体系中,含有模板DNA40 ng,dNTPs0.2 mmol/L,引物0.8 umol/L,Taq DNA聚合酶1U,MgCl22.5 mmol/L和10×PCR Buffer(Mg2+ free)2uL。此外,还筛选到10条扩增稳定、条带丰富的候选引物,并确定了其最佳退火温度,为开展朝鲜碱茅ISSR的有关研究奠定了基础。