HBx上调LincRNA UCA1在肝癌组织细胞中的表达分析

来源 :遗传学与表观遗传学前沿暨第三届中国青年遗传学家论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bendanban
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  慢性乙肝病毒((Hepatitis B virus,HBV)感染与肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)的发生具有十分密切的关系.乙型肝炎病毒X蛋白(HBx)被认为是参与慢性乙型肝炎病理过程和诱发肝癌的最重要的蛋白质,但是其诱发肝癌发生的具体分子机制尚不十分清楚.长链非编码RNA(Long Non-coding RNA,LncRNA)是一类功能性非编码RNA,缺少有效的开放阅读框不编码蛋白质,却具有复杂的生物学功能,在各种生物学进程中发挥重要作用,包括肿瘤的发生发展.本研究首先利用HBx稳转肝正常永生化细胞系LO2,高通量lncRNA芯片分析获得受HBx影响的lncRNA分子.生物信息学分析构建了lncRNA与mRNA间的共表达关系网络,结合qPCR复正,确定候选与HBV-HCC发生有关的一些lncRNA分子,进一步在临床肝癌组织中进行IncRNA表达分析.结果显示,HBx-lncRNA差异表达芯片中上调的lncRNA 379条,下调724条(fold change≥2,P<0.05),基因间的lncRNA占绝大部分比例.通过RT-qPCR方法验证芯片结果,筛选出几个HBx差异高表达的候选lncRNA,其中包括UCA1.细胞系中过表达HBx可上调UCA1的表达.在正常肝组织、肝癌癌旁组织和肝癌组织中分析发现,UCA1的表达水平与HBx存在正相关关系.尽管在4例正常肝中也未检测到有UCA1的表达,但相对于邻近的癌旁组织,UCA1在30例肝癌组织中表达下调(28/30).已有研究报道,UCA1在膀胱移行细胞癌中相对癌旁组织高表达,并且能促进细胞的增殖和侵袭.本研究在肝癌临床病例中观察到了与此相异的表达谱,提示HBx上调的UCA1参与肝癌的发生发展过程有其独特的机制.
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