水通道蛋白(Aquaporins,AQPs)与植物体内水分运输密切相关,最终影响植物的抗旱性.以甜橙数据库AQPs序列为基础,对其进行全基因组分析,进一步比较相关基因在耐旱性不同的柑橘幼苗干旱条件下表达差异.植物材料为4个月的三湖红橘(抗旱)和三湖化红(不抗旱)实生苗,种子采自于江西省新干县三湖镇.干旱胁迫采用盆栽控水法,以正常灌溉为对照,于处理后0、5和10 d取植物叶片和根系,液氮速冻后于-80 ℃保存,用于RNA提取.AQPs基因的表达使用CFX96 touch实时荧光定量PCR仪(美国Bio-Rad)完成.在拟南芥基因组数据库(https：//www.arabidopsis.org/)中获取AQPs序列,以此为搜索序列在甜橙基因组数据库(http：//citrus.hzau.edu.cn/orange/index.php)运行BLAST程序,获得到甜橙AQPs序列.蛋白序列等电点和分子量使用在线服务工具ExPASy进行预测；氨基酸多序列比对用DNAMAN软件进行；蛋白跨膜区域采用在线服务工具TMHMM预测；进化树构建使用MEGA6软件Neighbor-Joining算法完成；基因的染色体定位使用MapInspect软件完成；基因结构分析使用在线服务工具GSDS完成.结果表明,在甜橙全基因组中共鉴定了34个AQPs家族成员.根据其序列相似性和进化分析,AQPs可分为5个亚家族：PIP、NIP、TIP、SIP和XIP,分别含有11、8、9、3、3个成员.预测AQPs的蛋白长度为198～354个氨基酸残基,等电点在4.83～10.07之间,分子量范围为21.1～39.9 kD.序列分析表明,柑橘AQPs均具有6个跨膜域,为疏水性的全α型跨膜蛋白质.此外,AQPs成员具有较强的氨基酸保守性,含有2个NPA(Asn-Pro-Ala)保守基序和1个ar/R(aromatic/arginine)分子筛.染色体定位显示,除CsTIP1；1的定位不明确外,其余33个AQPs不均匀地分布于甜橙的9对染色体上,其中6号上最多,有8个.不同AQPs的基因结构也不尽相同,4个基因含有1个内含子,12个基因含有2个内含子,10个基因含有3个内含子,7个基因含有4个内含子,CsSIP1；1没有内含子.利用实时定量PCR分析家族成员在干旱胁迫下表达模式,结果表明：干旱不同时间后,三湖红橘叶片中 CsPIP1；3/2；2/2；3/2；5/、CsNIP1；1/1；2/4；1/4；2/5；1/6；1、CsTIP2；2/3；1/3；2/4；1、CsSIP2；1和CsXIP2；1 的表达量均显著升高,根中 CsPIP1；3、CsNIP2；1/4；1、CsTIP1；1/1；2、CsSIP2；1 和CsXIP2；1的表达量往往低于对照.同时,导致CsPIP2；1/2；2/2；3、CsNIP1；1、CsTIP2；1/3；1/3；2、CsSIP1；2和CsXIP1；1/1；2的表达量显著高于对照,根中 CsPIP1；2/2；4/、CsNIP1；2/2；1/5；1/6；1/7；1、CsTIP1；1/1；2/2；1/2；2/3；1/3；2/4；1/5；1、CsSIP1；1/2；1 和CsXIP1；1/1；2/2；1 的表达量则下降.