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本研究利用河口三维水流数值模式平面变量空间配置的交替网格方法，设计并发展了速度和水位的交替分层法，成功地解决了垂向等平面z 坐标模式将实际海底变为台阶状的问题。在ccost-2d 水动力模式的基础上，发展了采用垂向z 坐标模式而又能保证实际海底底边界模拟的三维水动力数值模式ccost-3d。以珠江西四口门网河与海区的整体计算模拟为算例，求解得到三维流场，水平表层速度分布和口门河道纵向剖面速度分布计算合理。