人前列腺LRIG1蛋白三维结构同源模建及其功能蛋白的虚拟筛选

来源 :第十次全国中西医结合男科学术大会暨第六届广西中医、中西医结合男科学术大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:skyfis
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  目的:探讨人前列腺LRIG1蛋白的三维结构同源模建,虚拟筛选LRIG1的功能蛋白。 方法:以LRIG1的同源蛋白LRRC4C蛋白的晶体结构(PDB号3ZYJ)为模型,通过MODELLER软件搭建LRIG1蛋白的三维空间结构;采用柔性对接的虚拟筛选技术,以荷兰SPECS公司的202490个化合物进行对接和打分,挑选出排名靠前的10个小分子化合物;通过AMBER软件分别进行20ns的分子动力学模拟,并通过分析这10个小分子的结合模式、动力学轨迹的RMSD、RMSF、结合口袋的氢键以及它们的结合能量。结果:10个小分子化合物都具有一致的结合模式,而且都具有激活LRIG1活性的潜在能力。结论:发现与人LRIG1具有潜在特异结合能力的激动剂,可以为前列腺癌治疗新靶点的确立及开发具有药理活性的先导化合物提供理论依据。
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