【摘 要】
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1引言北京鸭是世界知名的肉鸭品种,由其烹制的北京烤鸭更是冠绝中外.脂肪性状是影响北京鸭烤炙性能的主要经济性状,但是传统的通过同胞屠宰测量皮脂性状方法不仅提高了育种成本,同时也影响选育的准确性.因此研究北京鸭脂肪发育的分子遗传机制是有相当的必要性的.2材料与方法选取648只烤炙型北京鸭(322只公鸭,326只母鸭),地面平地饲养,自由采食,饲养6周.在六周末停止供食,测定其体尺性状,测定完毕后,进行
【机 构】
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中国农业大学动物科技学院,北京100193 北京金星鸭业有限公司,北京 100087
【出 处】
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中国畜牧兽医学会家禽学分会第十八次全国家禽学术讨论会
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1引言北京鸭是世界知名的肉鸭品种,由其烹制的北京烤鸭更是冠绝中外.脂肪性状是影响北京鸭烤炙性能的主要经济性状,但是传统的通过同胞屠宰测量皮脂性状方法不仅提高了育种成本,同时也影响选育的准确性.因此研究北京鸭脂肪发育的分子遗传机制是有相当的必要性的.2材料与方法选取648只烤炙型北京鸭(322只公鸭,326只母鸭),地面平地饲养,自由采食,饲养6周.在六周末停止供食,测定其体尺性状,测定完毕后,进行个体屠宰,提取每个个体的血液DNA.经过解剖,收集其皮脂重、皮脂厚、腹脂重、半净膛重等屠宰性状,计算其皮脂率及腹脂率.提取血液基因组,内切酶消化后建库,采用Hiseq2500进行简化基因组测序.收集测序数据,去除含adaptor和N的比例大于3％的reads.去除Q20＜90％的数据.使用BWA mem软件将数据比对到鸭参考基因组上,质控后使用GATK软件进行基因分型.使用beagle软件对数据进行填充,使用plink完成数据质控以及格式转化,使用Eigensoft完成群体结构分析,采用GCTA混合线性模型完成关联分析,统计以及单倍型分析由R软件完成.
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