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以10个随机引物对荞麦属(Fagopyrum)11个种(含大粒组7个种，小粒组4个种)共50份栽培及野生荞麦资源进行了RAPD研究。初步建立了荞麦属不同物种的RAPD指纹图谱。系统聚类分析表明荞麦属大粒组和小粒组之间以及不同荞麦种间在DNA水平上差异极大。在大粒组中苦荞DNA与其他种之间有较大的差异。大野荞和毛野荞分别与甜荞和苦荞在RAPD水平上较近缘，支持它们分别是甜荞和苦荞祖先种的假说。