【摘 要】
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目的：探讨哈萨克族食管癌与抗原呈递元件成员基因启动子区甲基化水平的关系和意义.方法：利用专业软件设计TAP1,TAP2,LMP2,LMP7,Tapasin,ERp57,ERAP1和HLA-B基因启动子区含CpG岛特异性硫酸氢盐测序法(bisulfite-sequeneing PCR-BSP)引物,对食管癌ECa109细胞DNA进行亚硫酸氢盐修饰、目的片段扩增、质粒载体克隆和测序,确定该区域所含Cp
【出 处】
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全国肿瘤病因学和肿瘤流行病学学术会议
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目的：探讨哈萨克族食管癌与抗原呈递元件成员基因启动子区甲基化水平的关系和意义.方法：利用专业软件设计TAP1,TAP2,LMP2,LMP7,Tapasin,ERp57,ERAP1和HLA-B基因启动子区含CpG岛特异性硫酸氢盐测序法(bisulfite-sequeneing PCR-BSP)引物,对食管癌ECa109细胞DNA进行亚硫酸氢盐修饰、目的片段扩增、质粒载体克隆和测序,确定该区域所含CpG序列的甲基化情况；收集哈萨克族30例食管癌组织和30例癌旁正常新鲜组织标本,提取DNA,采用Sequenom MassARRAY技术平台(质谱分析)定量分析HLA-B,TAP2,Tapasin,ERp57和LMP7基因启动子区甲基化水平；应用免疫组织化学方法检测HLA-B,TAP2,Tapasin,ERp57和LMP7蛋白表达情况,并分析蛋白表达与基因甲基化关系.结果：(1) BSP结果显示：TAP1,TAP2,LMP2,LMP7,Tapasin,ERp57,ERAP1和HLA-B基因相应目的片段各含23个,8个,22个,21个,12个,18个,12个和14个CpG位点,在食管癌ECa109细胞基因组DNA中,分别有0,8个,0,2个,5个,18个,0和11个CpG位点发生甲基化.(2) MassARRAY结果显示：在HLA-B,TAP2,LMP7,tapasin和ERp57基因启动子区CpG片段中仅有LMP7基因总体甲基化水平在哈萨克族食管癌中(0.0517±0.0357)高于癌旁正常组织(0.0380±0.0214),差异有统计学意义(P＜0.05)尽管其他四个基因在食管癌组织中甲基化水平明显高于癌旁正常组织,但其差异无统计学意义(P＞0.05).进一步分析食管癌和癌旁正常组织中单个CG位点甲基化水平,发现HLA-B的11个CG位点中HLA-B_CpG_1.2,HLA-B_CpG_12和HLA-B_CpG_13位点差异有统计学意义.TAP2的8个CG位点中TAP2_ CpG_7位点差异有统计学意义.LMP7的22个CG位点中LMP7_CpG_5, LMP7_CpG_9, LMP7_CpG_20, LMP7_CpG_21和LMP7_CpG_22位点差异有统计学意义.ERp57的8个CG位点中ERp57_CpG_1位点差异有统计学意义.Tapasim的12个CG位点中Tapasim_CpG_1,Tapasim_CpG_6位点差异有统计学意义.(3)免疫组织化学结果显示：HLA-B,LMP7和ERp57蛋白表达与基因甲基化改变呈负相关.结论：哈萨克族食管癌组织中,HLA-B,TAP2,LMP7,tapasin和ERp57基因启动子区CpG岛并非每一个CpG位点的甲 基化都会导致或影响该基因表达水平下调或表达缺失,而该基因CpG岛中只有某些CpG位点甲基化后,才能引起该基因表达沉默,这样的位点可能就是关键性CpG位点.
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