论文部分内容阅读
目的：合理设计新的以HIV-1跨膜蛋白gp41为靶点的抑制剂。
方法：采用两种分子对接方法研究gp41与其抑制剂NB-2的结合模式，利用从头药物设计方法(LeapFrog)改造NB-2的结构以设计新型有效的gp41选择性抑制剂。并用对接方法模拟评价这些新化合物的结合模式和能力。
结果：得到两种合理的NB-2与gp41的结合模式，从较好地结合模式出发设计了103个新的化合物并计算了结合自由能。这些化合物具有已知gp41抑制剂所没有的结构特征，并且其结合自由能都比NB-2低。
结论：本研究为进一步进行HIV-1gp41抑制剂的结构改造提供了指导作用。