茶树八氢番茄红素脱氢酶cDNA全长克隆与表达分析

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八氢番茄红素脱氢酶是类胡萝卜素生物合成途径的关键酶之一,本实验采用3’/5’RACE和RT-PCR技术成功扩增出茶树八氢番茄红素脱氢酶基因(PDS)的3’端和5’端序列,序列拼接获得全长cDNA序列,命名为CsPDS,并将其登录至GenBank,登录号KF646537.经生物信息学分析,所得基因cDNA序列全长为2295bp,开放阅读框(ORF)1749bp,编码582个氨基酸,预测分子量约为64.86kDa,理论等电点(PI)6.77,亲水性蛋白.该基因编码的氨基酸序列与柿树PDS序列的同源性达到87%,多序列比对表明茶树PDS 具有高度保守区域,基于邻接法的进化树显示与柿树、葡萄的亲缘关系最近.实时荧光定量PCR分析结果显示,CsPDS 在“黄金芽”体内表达没有受抑制,表明“黄金芽”黄色白化可能不是在CsPDS基因转录水平异常而引起.
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