抗生素所致腹泻小鼠肠道内容物细菌乳糖酶基因的多样性

来源 :中国微生物学会第十六届全国微生物学教学和科研及成果产业化研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tank2203555
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  目的 探究抗生素所致腹泻小鼠肠道内容物细菌乳糖酶基因的多样性.方法 将12只SPF级KM小鼠随机分为正常组(n=6)和模型组(n=6),模型组采用混合抗生素溶液0.4 mL/(只·次)灌胃造模,正常组给予等量蒸馏水灌胃,每天2次,连续5天.造模成功后,分别采集正常组和模型组小鼠空肠到回肠段内容物,并进行宏基因DNA提取和细菌乳糖酶基因扩增测序分析.结果 从OTU总数来看,模型组有871个,正常组有963个,二者相同的有690个.从Alpha多样性指数来看,正常组的Chaol指数和ACE指数均远远高于模型组(p<0.05).从PCA,PCoA,NMDS分析来看,正常组分布相对集中,样本间距离近,模型组样本分布相对分散且与正常组样本距离较远.物种进化及丰度分析可知,肠道内容物细菌乳糖酶基因主要来源于Actinobacteria、Proteobacteria、Firmicutes和Unclassfied,Proteobacteria是细菌乳糖酶基因已知物种来源的优势物种,模型组Bradyrhizobium sp.BTAi1,Agrobacterium sp.H13-3,Acidovor sp.KKS 102,Azoarcus sp.KH32C,Aeromonas caviae来源的的乳糖酶基因丰度低于正常组.从属水平数量分析,lcnl、lcn2、lcn3、lmnl、lmn2和lmn3分别统计到79、79、80、72、75、81个不同来源的属,己知物种中Gordonia,Mycobacterium,Frankia,Microbacterium,Novosphingobium,Aeromonas来源的乳糖酶基因只存在于正常小鼠,Micromonospora,Paenibacillus,Ensifer来源的乳糖酶基因则只存在模型小鼠.从属水平丰度分析,已知物种中细菌乳糖酶基因丰度水平较高的属有Corynebacterium,Arthrobacter,Bradyrhizobium,Acidovorax,Azoarcus,Enterobacte,Klebsiella,Pseudomonas.从热图分析可知,属水平丰度前27位的分类水平共分为三大分支,样品lmnl、lmn2归为一类,lcnl、lcn2、lcn3和lmn3归为另一类,正常组和模型组内容物细菌乳糖酶基因丰度水平较高的属明显的分开,正常组乳糖酶基因来源丰度较高的属有Gordonia、Frankia、Novosphingobium、Mycobacterium、Agrobacterium、Aeromonas、Microbacterium.结论 肠道内容物细菌乳糖酶基因具有高度的多样性和新颖性,抗生素所致小鼠腹泻后,肠道内容物细菌乳糖酶基因多样性明显降低,与正常小鼠乳糖酶基因来源群落结构差异显著.
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