丹霞梧桐转录组测序及微卫星引物开发

来源 :广东省植物学会2012年年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xjc132
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  梧桐属的狭域特有现象突出,我国所产的7种中有5种为我国特有种.为探讨该属狭域物种的物种形成模式及其遗传多样性.本研究采用高通量测序技术Illumina GA对典型的狭域分布种丹霞梧桐转录组进行测序,得到53,359条长度在200bp以上的转录组序列,从中筛选出1531条可用的含有1549个SSR位点的基因,利用Primer 6.0设计出了100对特异性引物.后以丹霞梧桐,海南梧桐,广西火桐等狭域分布种作为模板进行PCR扩增,成功筛选出13条至少在这三个梧桐物种的一种中具有多态性的SSR引物.从而为梧桐属狭域物种的保育研究及群体间的遗传分化研究,提供可靠的分子标记工具.
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