水产品荧光假单胞菌双组份信号转导系统生物信息学分析

来源 :中国食品科学技术学会第十七届年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wlcbgtxx
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  荧光假单胞菌是冷藏鱼类的特定腐败菌。双组分信号转导系统(TCSs)作为一种能识别和应对多种环境刺激的信号转导机制对荧光假单胞菌在冷藏环境中的生长和致腐是至关重要的。为探究水产品荧光假单胞菌TCSs 的结构和功能,本研究通过生物信息学方法对由本实验室分离并完成全基因组测序的水产品荧光假单胞菌PF08 菌株的TCSs 进行预测,将预测到的TCSs 与假单胞菌属其它模式菌进行了比对,并对其结构、功能和进化关系进行了分析。结果表明荧光假单胞菌PF08 菌株中存在63 个组氨酸激酶(HKs)、84 个应答调控子(RRs)、39 个成对TCSs、25 个融合HKs;该菌株的39 对TCSs 有25 对的生物学功能得到预测,其主要参与调控荧光假单胞菌PF08 的营养元素代谢、生物体内物质运输、细胞形态分化、应对不利环境及细胞抗性和毒力等。本研究对水产品荧光假单胞菌PF08 菌株中的TCSs 进行了系统的分析,为进一步探究TCSs 在荧光假单胞菌的调控功能提供了一定的参考。
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