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知识经济时代的到来,使科技成果转化量逐年攀升.在这一过程中,对科技成果知识产权的保护不仅可以减少科技成果转化过程中的争议,还可以有效提高科技成果转化的经济价值,保证成果顺利实现产业化。本文重点阐述了医药科技成果转化过程中新药知识产权保护现状问题，并提出了加强医药研发、生产企业对新药知识产权的自主保护意识；完善医药研发、生产企业对新药知识产权的管理体系；建设专业的知识产权管理机构等的完善措施，藉此推动我国医药行业科技成果转化过程中知识产权保护体系的构建。