杂色鲍发育转录组分析

来源 :2012年中国水产学会水产生物技术专业委员会年会暨水产基因与种业学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lyx2597758

【摘要】

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　　应用新一代高通量测序技术454 GS FLX对杂色鲍(Haliotis diversicolor)不同发育阶段和成体各组织的转录组进行了测序.获得61.3万个reads,总长度206M.用SeqClean和Newbler

【出处】

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2012年中国水产学会水产生物技术专业委员会年会暨水产基因与种业学术研讨会

【发表日期】

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2012年期

【关键词】

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杂色鲍不同发育阶段通路分析总长度有效数据功能分类测序技术 SSR分析

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　　应用新一代高通量测序技术454 GS FLX对杂色鲍(Haliotis diversicolor)不同发育阶段和成体各组织的转录组进行了测序.获得61.3万个reads,总长度206M.用SeqClean和Newbler对数据进行预处理后获得50.8万个reads,总长度172M.并分别对有效数据进行了拼接、SSR分析、SNP分析、注释、unique transcripts分析、GO功能分类和KEGG Pathway通路分析.

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