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结合现代控制理论与船舶主推进轴系纵向振动理论，提出基于二次型最优控制算法的船舶主推进轴系纵向振动主动控制策略。以某船主推进轴系为计算实例，分析单位脉冲激励条件下二次型最优控制策略对主推进轴系纵向振动的控制效果。理论计算结果表明，最优控制后的主推进轴系纵振响应被有效降低。并进一步研究主动控制系统参数对控制效果的影响，如权矩阵和时滞，为主推进轴系的纵向振动主动控制系统的工程化应用提供理论基础。