禽传染性支气管炎病毒分离株S1基因系统进化分析

来源 :四川省畜牧兽医学会2012年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:LIU_XX
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  对11株2010年分离的IBV分离株的S1基因进行了PCR扩增,建立基于879株IBV的全长S1基因系统进化树,对11个分离株进行系统进化分析。结果表明:11株分离株均获得了预期大小的目的条带,11株分离株的S1基因长度介于1614~1620bp之间,A+T的含量介于63.21~63.83%-之间。11个毒株S1基因之间的遗传距离为0.001~0.328,同源性为78.3~99.9%。建立基于879条IBV S1基因的系统进化树,发现来自全球的879株IBV的S1基因可以分为5个群,其中中国IBV分离株在clusterⅡ/Ⅳ/Ⅴ中有分布,说明中国是全球IBV的S1基因型最丰富的地区。本研究中的11株IBV毒株分布在ClusterⅤ的3个亚群中,均与其他中国分离株的亲缘性较近,且多属于疫苗株以外的基因型,提示中国应考虑使用新的与本地株亲缘关系较近的IBV毒株研发疫苗。本研究丰富了IBV分子流行病学素材,为IBV分子流性病学研究中对新分离株的基因型判定提供科学依据。
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