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苜蓿是世界上最重要的豆科牧草之一，对苜蓿的遗传改良是苜蓿育种者的目标。而苜蓿遗传图谱构建是解析重要农艺性状(QTLs)遗传特性和基因连锁分析的前提条件。
本研究以苜蓿的F2家系(高产紫花苜蓿×高抗黄花苜蓿)作为构图群体，应用MAPMAKER/EXP(3.0)与JionMap4.0并结合MapDrawV2.1软件构建了苜蓿的遗传连锁图谱。对94个F2家系个体考察了包括鲜重在内的16个重要农艺性状。利用单标记法分析了这16个性状的数量性状基因座位(QTLs)，其主要结果如下：
1.构建了包含51个RAPD标记的苜蓿遗传连锁图，其中包含8个连锁群，标记覆盖的基因组总长度约为1261.5cM，标记间平均距离为24.73cM。
2.连锁的51个标记位点中，15个卡方检验显著，符合3:1的分离比例，占29.4％。偏分离比例为70.6％。
3.16个农艺性状共检测到了26个QTLs，其中，鲜重的QTLs5个；控制干重的QTLs1个；株高的QTLs1个；主茎高的QTLs1个；分枝数的QTLs1个；幅宽的QTLs2个；抗寒性的QTLs6个；蛋白质的QTLs3个；Ash的QTLs1个；糖分的QTLs1个；P的QTLs3个；Ca的QTLs1个，分别被定位于8条连锁群上。