诱变酒酒球菌菌株中耐酸候选基因的筛选及功能验证

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:china_huohou
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
酒酒球菌(Oenococcus oeni,O.oeni)是葡萄酒中苹果酸-乳酸发酵(Malolactic fermentation,MLF)的主要菌株,它可以适应葡萄酒恶劣的环境,在葡萄酒中起着降低酸度和柔和口感的作用。葡萄酒中的低p H是限制O.oeni生长的一个重要因素,因此筛选鉴定O.oeni的耐酸基因可以为优良发酵菌株的筛选奠定良好的基础。实验室前期对诱变得到的3对O.oeni抗酸菌株和酸敏菌株进行重测序,通过比对抗酸菌株和酸敏菌株之间的SNP差异,共定位到178个耐酸候选基因。本研究通过提取DNA序列,去除仅发生同义突变的序列和查阅文献等方法对178个耐酸候选基因进行初筛;然后,利用实时荧光定量技术(RT-q PCR)测定初筛得到的耐酸候选基因在诱变O.oeni抗酸菌株b1和酸敏菌株b2于p H 4.8和3.0培养条件下的表达量,通过表达量的差异进一步缩小耐酸候选基因的范围并从中挑选后续分析的目标基因;之后,对来源于抗酸菌株和酸敏菌株的目标基因氨基酸序列进行比对并进行功能结构域、跨膜结构域及系统发育树等方面的生物信息学分析;最后,构建目标基因的过表达载体,电转到植物乳杆菌(Lactobacillus plantrum,L.plantrum)中,在胁迫条件下(p H 3.2的MRS培养基)测定重组L.plantrum的生长能力,进行抗酸功能的验证。主要研究结果如下:1)利用Perl脚本共从库中提取178个耐酸候选基因的DNA序列,将其分别转换为氨基酸序列后经比对发现,有20个耐酸候选基因仅发生同义突变,158个耐酸候选基因发生了非同义突变。根据已发表的文献报道,从158个耐酸候选基因中共挑选出38个基因进行RT-q PCR,结果表明其表达趋势表现为三类:I)抗酸菌株与酸敏菌株的表达量变化趋势一致,均呈显著上调或者下调趋势;II)抗酸菌株和酸敏菌株表达量变化趋势相反,抗酸菌株表达量显著上调,酸敏菌株表达量显著下调,或抗酸菌株表达量显著下调,酸敏菌株表达量显著上调;III)仅抗酸(酸敏)菌株表达量上调或者下调,酸敏(抗酸)菌株表达量保持不变。依据RT-q PCR结果将范围缩小到10个耐酸候选基因。其中Gene 10(ATPase基因,OEOE_RS01075)表达趋势属于第一类,在抗酸菌株b1和酸敏菌株b2中均显著上调且上调幅度较大,在抗酸菌株b1中上调13.30倍,酸敏菌株b2中上调5.10倍;Gene 14(fts H,OEOE_RS00895)的表达趋势属于第三类,在抗酸菌株b1中表达量基本保持不变,在酸敏菌株b2中显著上调,另外,有相关文献证实fts H具有抗逆相关功能。因此,以Gene 10(ATPase基因)和Gene 14(fts H)作为后续生物信息分析和功能验证的目标基因。2)氨基酸序列比对及结构域预测(功能结构域及跨膜结构域)结果显示,ATPase共发生5处非同义突变,其中3处位于功能结构域内;Fts H共2处非同义突变,其中1处位于跨膜结构域内,在功能结构域内无突变。系统发育树结果表明,O.oeni的ATPase和L.plantrum中相应蛋白的同源性为55%,Fts H与L.plantrum中相应蛋白的同源性60%。这表明O.oeni中ATPase和Fts H的氨基酸序列与L.plantrum中的序列存在一定的差异。3)异源表达功能验证试验结果表明,ATPase(抗酸型)和ATPase(酸敏型)均可以提高重组L.plantrum的抗酸性,说明ATPase中的5处突变未影响其抗酸功能;Fts H(抗酸型)也能提高重组L.plantrum的抗酸性,但Fts H(酸敏型)不能提高重组L.plantrum的抗酸性,推测Fts H(酸敏型)在跨膜结构域发生的突变引起抗酸能力丧失。
其他文献
全球气候变暖造成葡萄原料酸度过低、p H升高,从而引发一系列的问题。葡萄原料酸度过低,会破坏葡萄酒酸度和甜度平衡,造成葡萄酒味感过于寡淡。此外酸度过低会导致腐败微生物大量繁殖,从而增加葡萄酒酿造和存储过程中微生物污染的风险。工业发酵一般向葡萄醪中添加有机酸(如酒石酸)以解决酸度过低的问题,但该法会增加酿造成本且常常造成葡萄酒口感过于生硬。论文以筛选获得的8株植物乳杆菌(Lactobacillus
学位
苹果是我国主要栽培果树,苹果产业是我国农业重要产业。苹果病毒病为威胁苹果产业可持续发展的重要病害。近年来,苹果锈果类病毒病害在我国品苹果主产区发生具有逐渐加重的趋势,目前尚缺乏有效的防治苹果类病毒的化学药剂。本研究拟利用新型蛋白诱抗剂及生物菌剂探索防治苹果锈果类病毒病害可能性。通过苹果愈伤组织病程相关蛋白基因表达探究生物制剂可能的抗性机制。主要取得了以下研究结果:1、进行了苹果病毒检测方法及带毒情
学位
软蜡蚧亚科(Coccinae)隶属于半翅目(Hemiptera)胸喙亚目(Sternorryncha)蚧总科(Coccoidea)蜡蚧科(Coccidae)。蜡蚧虫体较小,生活环境隐蔽,通常寄生于植物的枝、叶、果实上;通过刺吸植物汁液,破坏植物组织、细胞,影响其进行正常的光合作用,导致植物生长畸形,叶片枯萎,甚至死亡,因此成为农、林和园艺等植物重要的害虫之一。本文对软蜡蚧亚科在国内外的研究概况,分
学位
miRNA是基因调控网络中的重要一员,其成熟体由20-24个核苷酸构成,能与靶向基因的mRNA互补后对其进行切割或抑制翻译使靶标基因的功能丧失。miR156是植物中一种非常保守的miRNA,其靶标基因中研究较多的是SBP转录因子,二者共同调控植物的生长发育过程,但目前相关工作主要集中在模式植物拟南芥中,而在作物中的相关研究较少。本文研究了miR156对番茄外植体转化效率的影响,并获得了部分转基因材
学位
白菜原产于中国,是十字花科作物,杂交一代优势明显。现在杂交种子生产的主要途径就是用自交不亲和系进行制种。但是自交不亲和系制种存在很多缺陷,比如:人工授粉费用增加、自交多代植株长势弱化等。因此,筛选出适合于白菜制种所用的化学杀雄剂,找到白菜抗化学杀雄剂材料,利用抗性材料做父本,敏感材料做母本进行杂种一代的生产就显得尤为重要。目前,还没有在白菜上的应用化学杀雄制种的报道。本试验以4种常用的除草剂来进行
学位
无核葡萄深受消费者的喜爱,具有很大的经济价值。研究无核葡萄无核性的形成原因对培育优质无核葡萄具有重要意义,但无核葡萄无核性状的形成机制一直未被揭示。本研究依据实验室前期的研究结果,选择在无核葡萄无核白和有核葡萄黑比诺花后不同时期胚珠中差异表达的VvHDZ27作为研究对象,探究其对胚珠发育的影响,为阐明无核葡萄胚珠败育调控机制提供理论基础。主要研究结果如下:1.利用q RT-PCR检测了VvHDZ2
学位
本研究主要围绕着粘虫中肠V-ATP酶中的两个蛋白质和小麦条锈菌相关蛋白的纯化进行研究。分为两个部分:一是苦皮藤素V对东方粘虫中肠V-ATP酶A、B亚基复合物ATP水解抑制的研究;二是小麦条锈菌(Puccinia Striformis f.sp.Tritici,pst)效应蛋白pst-268,pst-4941,pst-5578及靶标蛋白Ta ISP的表达纯化。苦皮藤素是从苦皮藤中分离出的对农业害虫具
学位
猪苓[Polyporus umbellatus(Pers.)Fries]为多孔菌科药用真菌,我国传统中药材,猪苓多糖是猪苓中的重要活性物质,具有抗肿瘤、抗氧化,调节机体免疫力等功效。近年来,我国医疗事业不断发展壮大,尤其是中医药产业发展迅速,人们对传统中药材的应用愈加重视。随着猪苓多糖药理研究的发展,猪苓在临床中应用增多,因此,猪苓需求量呈增加趋势。然而,目前猪苓的生物学特性尚不完全清楚,人工半野
学位
果实大小/形状是由多基因位点控制的数量性状,其遗传基础较复杂。研究黄瓜果实大小/形状相关基因的功能,解析果实大小/形状育成的调控机制,对其品质和产量育种具有重要意义。本实验室前期已鉴定到CsSUN为FS1.2的候选基因,圆果实WI7239在CsSUN的第一个外显子中有161 bp片段的缺失;之后对FS2.1精细定位筛选出基因CsLNG1可能是该位点最优候选基因,圆果实WI7239在CsLNG1的第
学位
土地荒漠化是当前世界上一个重要的环境问题,它严重地影响和困扰着全人类的生存和社会的可持续发展。中国是世界上土地沙漠化危害最严重国家之一,沙漠化的防治成为不可忽视的问题。在众多防治方法中,生物防治可以从根本上改变土壤性质,提高沙漠生态系统稳定性,土壤微生物多样性、植物多样性和土壤酶都是反应土壤生物活性的指标。新疆塔克拉玛干沙漠公路对促进新疆经济发展起着至关重要的作用,本研究对沙漠公路外围不同矿化度地
学位