1997年金融危机的爆发让东南亚国家将金融合作提上日程,并在东亚范围内建立了金融合作框架——清迈协议和亚洲债券基金。2007年美国次贷危机造成的国际金融危机再次让东南亚国家认识到金融合作的重要性,开始将金融合作主体扩展至金融机构。区域金融机构合作作为区域经济合作的一个重要组成部分,除了对区域经济合作提供服务之外,也推动了区域经济一体化进程。本文主要是在区域经济一体化的背景下对泛北部湾区域内金融机构之间的合作进行研究。在对泛北部湾区域金融合作现状和深化可行性进行分析的基础上,着重对金融机构合作的内容进行了研究和阐述,从现实层面出发探讨了金融机构合作的具体方式及由此带来的好处,并针对合作中存在的阻碍因素,提出了相应的保障措施,以保证区域金融机构合作的顺利开展。泛北部湾区域内贸易和投资往来的日益频繁对区域金融机构的服务提出了挑战,金融机构的跨国合作在满足区域经济要求的同时也为自身的发展开辟了新的道路。泛北部湾区域金融和经济的相互作用对区域整体经济产生了巨大效用,既增强了区域的经济实力,又推动了区域经济一体化的进程。