葡萄座腔菌科（Botryosphaeriaceae）隶属子囊菌门Ascomycota,果囊菌亚门Pezizomycotina,座囊菌纲Dothideomycetes,葡萄座腔菌目Botryosphaeriales,分布广泛,是一类重要的植物病原真菌,可引起多种植物病害,以腐生、寄生或内生的生活方式在生态环境和生活环境中又发挥着不同的作用。目前该类真菌及相近类群的分类地位常不明晰,本研究对采集到与植物病害相关的葡萄座腔菌科真菌,利用分子系统学和形态学进行鉴定,为完善病害植物上该科真菌分类学研究提供一些参考依据。本研究的供试菌株于2017年9月至2020年8月采集自中国（贵州省、广西省、云南省、四川省、江苏省）和泰国（帕尧府、清莱府、楠府）,从具病害症状的植物叶、茎和果实上分离得到。采集到具有病斑的标本800余份,通过多基因分子系统学（SSU、ITS、LSU、tef1、tub2）和形态学的方法对样本上分离的真菌进行鉴定,从其中63份标本（包括一些未知名植物）上分到葡萄座腔菌科菌株124株,寄主包括27科34种植物。分离到的葡萄座腔菌科真菌隶属于7个属,于Botryosphaeria属有15株、Lasiodiplodia属有69株、Neofusicoccum属有27株、Cophinforma属有4株、Diplodia属有4株、Neodeightonia属有3株、Tiarosporella属有2株,其中1个中国新记录种,3个泰国新记录种。鉴定出19个种,6个未定种,其中3个新种（Botryosphaeria osmanthuse、Botryosphaeria salii和Lasiodiplodia syzygii）,16个已报道的种（Botryosphaeria dothidea、Botryosphaeria minutispermatia、Botryosphaeria auasmontanum、Lasiodiplodia theobromae、Lasiodiplodia mahajangana、Lasiodiplodia iraniensis、Lasiodiplodia pseudotheobromae、Lasiodiplodia chinensis、Lasiodiplodia thailandica、Neofusicoccum parvum、Cophinforma mamane、Cophinforma atrovirens、Neodeightonia rattanica、Neodeightonia palmicola、Diplodia seriata和Diplodia mutila）。本研究对分离自中国5省和泰国3府植物病害上的葡萄座腔菌科真菌进行分离鉴定,得出以下结论:（1）tef1基因为鉴定该科真菌的首选条形码基因,再结合ITS、tub2基因,即ITS+tef1+tub2三基因加合的分子系统学分析可解决葡萄座腔菌科真菌的分类问题;（2）葡萄座腔菌科真菌分布广泛,寄主多样。基本弄清了这些地区该科真菌的系统发育关系及其与寄主的多样性关系,对葡萄座腔菌科真菌引起的植物病害防治具有重要意义。