在科技活动中,存在典型的市场失灵现象,科技投入不能完全依赖于市场规律,因此,科技事业的发展必然需要政府公共财政的支持。近年来,随着我国各级政府科技投入强度的逐步加大,政府科技投入的绩效管理也成为学术界和相关政府部门关注的热点。本研究以江苏省政府科技投入绩效为研究对象,采用纵向与横向对比分析的方法对江苏省政府科技投入与产出的现状进行分析;在科学性、可行性、可比性、系统性和整体性原则指导下,根据政府科技投入绩效评价的目的,从投入与产出两个方面构建了江苏省政府科技投入绩效评价指标体系,并分析了这些指标的内涵;继而综合运用定性分析法和数据包络分析(DEA),从综合有效性、技术有效性、规模有效性以及规模收益等角度对1999-2008年江苏省政府科技投入绩效进行综合评价,主要结论如下:(1)从综合有效性的角度看,2006-2008年间及1999江苏省政府科技投入绩效为DEA有效;2000-2005年期间,江苏省政府科技投入绩效出现非DEA有效,造成非DEA有效的原因是这几年的科技产出相对不足,科技人力资源和科技资金的利用效率不高,造成产出的相对不足。(2)从技术有效性的角度看,1999-2008年期间,除2001、2002、2004这3年是技术无效外,其他年份都是技术有效。说明在这3年中,江苏省的科研机构对科技人力资源和政府科技资金没有达到完全有效利用的程度,科技投入产出的有效转化率相对另外7年偏低,但是,这3年技术效益的DEA分值都在0.9以上,如果相关部门能改善科技人力资源和政府科技资金的投入要素组合,对人力和资金加强管理,则可以有效的提高技术效率。(3)从规模有效性及规模收益的角度看,1999年和2006-2008年江苏省政府科技投入规模有效,规模收益不变,规模既不偏大也不偏小,处于规模合理阶段。2000-2005年政府科技投入规模无效。其中2003年规模收益递减,产出倍数的增长低于投入倍数的增长,此时规模偏大;2000-2002年以及2004-2005年这5年规模收益递增,产出倍数的增长高于投入倍数的增长,此时规模偏小。综合江苏省政府科技投入的综合有效性、技术有效性和规模有效性来看,2000-2005年江苏省政府科技投入产出绩效良好;而1999年和2006-2008年政府科技投入产出已经达到了综合效率、技术效率和规模效率均为1并且规模收益不变的良好发展态势,目前江苏省政府科技投入的产出绩效是在不断提升的,产出绩效优异。本研究认为,把握政府科技投入的正确方向是促进科技进步和社会经济协调发展的关键,提高政府科技投入效率的重要途径是改革科技投入机制,实现政府科技投入效益的根本措施是构建以人为本的科技创新体系。