肠杆菌属在院内耐药及相关基因研究

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目的:对我院2016-2018年病原微生物实验室分离的肠杆菌属的临床科室分布、标本类型及药敏变化进行分析,为临床医生选择抗菌素以及送检标本类型提供参考;对我院2016-2018年肠杆菌属部分相关耐药基因分布情况进行分析,为院感科在监测肠杆菌属耐药方面提供方法学参考——从耐药基因角度监测肠杆菌属耐药性变化,指导临床用药。方法:1研究对象:2016年1月至2018年12月我院门诊及住院患者送往病原微生物实验室经分离、鉴定为肠杆菌属的所有菌株。2目的菌株收集:根据2018版CLSI指南,使用K-B纸片扩散法对实验室经分离鉴定、保存的肠杆菌属菌株进行ESBLs酶确认实验,得到ESBLs阳性肠杆菌属菌株(对于同一个病人多次检测到相同耐药菌株,只分析第一株耐药菌)。3耐药性分析:应用WHONET5.6软件对LIS系统导出的肠杆菌属菌株信息进行分析,统计肠杆菌属菌株药敏变化、标本类型、临床科室分布情况。4耐药基因分析:设计CTX-M-1、SHV引物对ESBLs阳性肠杆菌属菌株进行PCR基因测序,分析CTX-M-1、SHV介导的ESBLs耐药现状。5统计学方法:利用SPSS21.0软件、SAS9.1.3软件对K-B纸片法、MIC法测得的目的菌株药敏结果的一致性、ESBLs阳性菌株与ESBLs阴性菌株耐药率的差异性进行统计学分析。结果:1 2016-2018年我院门诊与住院患者送至病院微生物室标本,经法国梅里埃(VITEK2 Compact)全自动细菌分析仪与纸片扩散法,对初步分离得到的菌株进行鉴定及药敏试验,共得到肠杆菌属菌株124株,其中阿氏肠杆菌(Enterobacter asburiae)1株,产气肠杆菌(Enterobacer aerogenes)22株,日沟维肠杆菌(Enerobacer gergoviae)2株,阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)99株;目的菌株大多数来自神经外科(19%)、泌尿外科(11%)、重症医学科1(9%),其标本类型主要为痰(56%)、尿液(17%)、血(10%)。2 2016年耐药率排在前三位的分别是哌拉西林(100%)、氨曲南(95%)、庆大霉素(90.5%),2017年耐药率排在前三位的分别是头孢曲松(36.5%)、哌拉西林(34.9%)、氨曲南(30.2%),2018年耐药率排在前三位的分别是头孢曲松(31.4%)、头孢他啶(25.5%)、氨曲南(24.4%),其中2016年肠杆菌属的耐药率高于全国平均水平,而2017年-2018年肠杆菌属耐药率与CRASS监测结果大致相似,有的甚至低于全国平均水平。3通过基因测序46株肠杆菌属菌株中有6株为CTX-M-3型ESBLs(13%)、有10株为CTX-M-15型ESBLs(21.7%)、有8株为SHV12型ESBLs(17.4%),主要存在阴沟肠杆菌中。4统计分析结果:K-B纸片法与MIC法测得的目的菌株药敏结果具有很好的一致性;肠杆菌属菌株产生的ESBLs酶可能与哌拉西林、呋喃妥因耐药存在一定关联。结论:1介导我院肠杆菌属ESBLs酶的耐药基因:CTX-M-1组为CTX-M-3、CTX-M-15基因亚型,SHV组为SHV12基因亚型,且两组耐药基因亚型主要存在阴沟肠杆菌中。2本研究有助于我院院感科进一步完善肠杆菌属耐药“基因谱”,从基因角度监测肠杆菌属的耐药趋势,指导临床合理用药。3我院肠杆菌属主要分布在神经外科、泌尿外科、重症医学科1病区,并主要以痰液、尿液、血液为媒介进行传播,其中以阴沟肠杆菌的检出率最高。4我院2016-2018年肠杆菌属对各种抗菌素耐药水平大致呈下降趋势,与同年CRASS监测结果比较发现,2016年略高于全国平均水平,2017-2018年两者总体耐药趋势大致相近或略低于全国平均水平,但也存在个别抗菌素的耐药率稍高于全国平均水平。
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