2010-2011年深圳市诺如病毒的分子流行病学研究

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研究目的:诺如病毒是常见的腹泻病毒,广泛存在于环境中,是引起非细菌性急性肠胃炎的主要病原之一。诺如病毒流行范围广,传播方式多样,遗传信息变化大。本研究将2010-2011年收集的腹泻样品进行检测,并结合前期的资料,从诺如病毒的感染情况及分子流行病学两方面进行判断分析,为诺如病毒的检测及预防提供基础资料。研究方法:将2010-2011年收集的样品经过前处理后,提取核酸。一部分核酸用作Real-time PCR的模板,并结合调查的资料从时间(月份)、年龄和性别等方面对这两年诺如病毒的感染情况进行分析。另一部分采用RT-PCR的方法,分别用NVG1和NVGⅡ特异性引物对其进行扩增,从分子水平分析近两年诺如GⅠ和诺如GⅡ基因组的流行趋势,并着重分析GⅡ.4型的流行状况。研究结果:1、2010年收集的925份标本中,有506份标本来自男性,419份标本来自女性,三岁及三岁以下的有480份,所占比例达52%。经过Real-time PCR检测,共鉴定出阳性标本186份,阳性率为20.10%,其中有96份来自男性,90份标本来自女性,三岁及三岁以下儿童感染诺如病毒的阳性数为104份,所占比例高达56%(104/186);2011年收集的983份样品中,有573份标本来自男性,410份标本来自女性,其中571名患者的年龄小于3岁,所占比例达58%。经Real-time PCR检测,共鉴定出阳性标本210份,阳性率为21.36%,其中有121份来自男性,89份来自女性,三岁及三岁以下儿童的阳性数为130份,所占比例高达62%(130/210)。2、经过RT-PCR扩增后,将有阳性条带的样品测序后进行比对分型。2010年共有85份样品成功测序,其中有78份样品属于NVGⅡ型,分属4种不同的基因型别,7份样品属于NVGⅠ型,分属3种不同的基因型别。在GⅡ基因组中比例最高的是GⅡ.4/2006b,共检测55份标本,占所有成功测序标本的64.5%(55/85),其次是GⅡ.4/2006variant,共检测出17份阳性样品,占所有型别比的20%;2011年共有60份样品成功测序,其中有55份属于NVGⅡ型,分属7种不同的基因型,5份属于NVG1型,分属4种不同的基因型。在所测的GⅡ基因组中,比例最高是GⅡ.4/2006b,共检测出28份,占所有基因型别比的46.7%。其次是GⅡ.4/2006b variant,共有10份阳性标本,占所有基因型别比的16.7%。研究结论:1.从这两年的数据来看,诺如病毒引起的腹泻在任何时节均可发生。但检出率较高的月份主要集中在3-7月份。在所有的腹泻人群中,以三岁以下儿童居多。将这两年诺如病毒在性别感染上的差异,通过SPSS软件分析,得到2010年卡方检验的P值=0.344>0.05,2011年卡方检验的P值=0.824>0.05,这两年的检测结果均无统计学差异。2.无论2010年还是2011年,NVGⅡ基因组所占比例都非常高,分别达到91.7%(78/85)和91.6%(55/60)。相对于2010年,2011年诺如病毒的基因型别更趋向多元化。2010年,GⅡ.4/2010开始出现,在所有检测出的基因型别中,比值高达20.0%(17/85)。GⅡ.4/2006b variant基因型是2011年新发现的基因亚型。2011年检测出的基因型别中,有10份属于GⅡ.4/2006b variant,比例高达16.7%(10/60)。从这两年的流行趋势看,NVGⅡ.4基因型的遗传信息较易发生变化,一旦出现新的基因亚型,便具有很强的流行能力。
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