中国共产党90年的发展历史，是与腐败不懈斗争的历史。党的十六大以来，是中国特色反腐倡廉道路形成阶段，制度反腐是新形势下党的反腐倡廉建设的历史和现实选择。本文以制度反腐为研究的理论基点，以制度反腐的主要构成为框架，以十六大以来反腐倡廉制度建设的实践和成果为内容，系统总结成功的方面和经验；同时对党的十六大以来世情、国情、党情、民情进行客观分析，强调制度反腐的实效性和发展性特征，研究性探讨在中国共产党领导下的制度反腐的进一步发展和完善。论文的第一部分主要对反腐模式的基础理论进行分析。不同的反腐理论决定了对腐败产生原因等诸多因素的不同认识，决定了反腐制度的出发点和价值目标，对寻租理论等四种典型的反腐败理论的研究，明确制度反腐构成的诸多要素。以此为基础，进一步分析运动反腐、组织反腐和制度反腐的反腐模式类型，从中归纳出反腐模式的本质特征。对权力的控制和监督，是新时期党的反腐倡廉建设及反腐模式的核心价值选择。论文的第二部分，对新中国成立之后到十六大以前中国共产党反腐模式的建立和发展进行了回顾。新中国成立初期和社会主义市场经济建设发展时期，反腐模式有历史性和局限性，运动反腐和组织反腐是主要的运作模式，在当时的历史条件下发挥了一定的作用，产生了一些问题。这是中国共产党反腐倡廉建设和反腐模式的发展与探索。随着历史的发展制度反腐成为了一种选择和需要。运动反腐、组织反腐有特定时期不可替代的历史作用，新的发展决定了制度反腐需要解决的核心问题和追求的价值目标。论文的第三部分，分析了十六大以来中国共产党制度反腐模式的发展原因，客观描述了这一时期世情、国情和党情的新变化。中国共产党历史使命的转换，决定了党执政理念和执政方式的新发展。这一时期的腐败方式，发生了新的变化，重新构建反腐模式是历史的必然。制度反腐要站在新的历史起点上，承担起全面推进党的建设，使中国共产党始终成为领导中国特色社会主义事业的坚强领导核心。论文的第四部分，以中国共产党第十六次全国代表大会召开为时间节点，阐述十六大以来到十八大之前制度反腐模式的确立和成效。党的十六大确定了中国特色反腐倡廉道路，反腐败斗争更加强调制度的作用，逐步向制度反腐方向全面发展，以制度建设为主要内容的反腐倡廉体系逐渐形成和完善，产生了初步的效果，制度反腐朝着科学的目标不断发展。论文的第五部分，着重分析当前中国共产党制度反腐模式遇到的新问题和新挑战。最主要的问题包括在制度规划问题上缺乏制度反腐的顶层设计；反腐制度制定主体过于宽泛；政策与法律之间的冲突；制度性腐败的出现；监督功能的缺乏；与国际反腐政策与法律的不完全对接。在制度反腐的框架下，运行和配套机制不健全、行政体制与制度反腐模式创新不能有机衔接等问题，是制度反腐模式创新的主要障碍。论文的第六部分，提出了新时期中国共产党制度反腐的创新思维，从总体思路和基本内容两个方面，强调了法治在制度反腐中具有重要的决定的作用；多种制度多种方式的共同治理，是整合优化相关制度的重要方式。特别是在腐败的高发期和经济社会的转型期，更要发挥法治反腐的底线作用，保证各种反腐制度的有效实施。在法治反腐的运行中，坚持党的领导、加快国家层面的反腐败立法、建立与国际对接的廉政评价体系是重要的问题。大胆设置制度反腐的实验特区，是推动制度反腐的重要实践。