随着我国经济的迅猛发展，政府投资项目和投资额在快速增多，随之在政府投资领域也暴露出了许多不容忽视的问题：投资项目决策失误；损失、浪费严重；低水平重复建设等等。在强调政府投资效益的呼声中，政府投资项目的绩效审计应运而生。而政府投资项目的绩效审计研究也已经成为审计理论研究面临的一个新课题。本文首先对这一问题的国内外研究现状、研究意义以及目前我国政府投资项目绩效审计发展状况等问题作了分析；其次，阐述了政府投资项目绩效审计的基本理论，着重介绍了政府投资和投资项目的概念、特点、现状以及投资项目绩效审计的内涵、必要性和相关理论基础等问题；再次，对成本-效益方法进行理论与实践探讨，重点是对成本与效益的内涵和外延进行分析，并引入机会成本等概念，构建研究的模型；最后，探讨政府投资项目进行绩效审计中成本—效益方法的具体应用问题，以及在现实中这一方法存在的问题及解决问题的对策。