十六大提出自主创新建设创新型国家战略后，在国家创新体系的大框架下讨论区域性创新成为创新研究的一项重要课题。特别是在国家西部大开发、振兴东北老工业基地及中部崛起等区域平衡发展战略的相继实施后，对各区域特别是中西部落后地区的创新发展产生了重要影响。本文借鉴国务院发展研究中心八大经济区的划分观点，以八大经济区为研究单元，着重研究其2002至2010年九年间的效率变动趋势。本文构建了以专利和技术市场交易额为中介的，从创新资源投入到成果产出及实现经济效益的全过程的三部分创新效率变动评价体系，运用数据包络分析模型DEB-Malmquist指数分别就创新成果产出阶段，创新成果经济化阶段，创新全过程阶段的效率变动情况，按照以区域为主线结合全国和区域内部各地方省市的发展情况，进行了较为系统和全面的详细分析。通过分析发现各区域在创新成果产出和创新成果经济化阶段，效率变动趋势走向不同的情况，反映了我国区域自主创新能力不足，需要大量外部资源来支撑国内产业的高速发展。另一方面区域间及区域内部各地方省市发展的不平衡是造成各区域创新效率呈现不同趋势的主要原因。如何就八大经济区各自的实际发展情况进行创新发展本文给出了一些建议，也是本文分析的又一个重点。总之，区域创新是一个系统化工程，创新效率的提高需要区域内部各地方的通力合作。在我国建立创新型国家的战略政策引导下，各区域应当根据自身的实际发展情况，制定相应的创新政策，使其经济发展相匹配，实现创新发展与经济发展的良好互动，创新效率和经济效率的共同提高。