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本文从以下几个方面进行论述: 第一部分:肺腺癌、鳞癌及腺鳞癌患者临床特征及预后分析 目的: 分析比较肺腺癌、鳞癌及腺鳞癌不同病理类型患者临床特征及生存预后。 方法: 本研究按照入组标准及排除标准整理数据后纳入美国SEER(Surveillance,Epidemiology, and End Results,监测、流行病学和结果)数据库2010-2015年诊断的单原发肺恶性肿瘤患者84597例,按照病理类型分为肺腺癌组、肺鳞癌组、肺腺鳞癌组。采用卡方检验进行各组基线资料比较;采用分组1∶1倾向性评分使各组间均衡可比;对分组匹配后的数据进行单因素Kaplan-Meier分析,比较不同病理类型患者生存时间的差别。 结果: 1、肺腺鳞癌构成比为2.23%,明显低于肺腺癌及肺鳞癌。2、肺腺鳞癌的发生在年龄、性别、婚姻状态方面无倾向性,肿瘤一般为低分化,恶性程度高。3、变量间卡方检验结果显示P值均小于0.001,差异有统计学意义;Cramers V系数均小于0.3,各协变量间存在低强度相关。4、经过精确匹配,得到三组均衡可比的队列:A组(肺腺癌和肺鳞癌组)16775对;B组(肺腺癌和肺腺鳞癌组)1393对;C组(肺鳞癌和肺腺鳞癌组)1181对。5、单因素生存分析,A组、B组P小于0.05,差异有统计学意义;C组P大于0.05,差异无统计学意义。 结论: 肺腺癌和肺鳞癌临床特征具有明显差异;肺腺鳞癌多表现为低分化状态,恶性程度较高;肺腺癌预后优于鳞癌及腺鳞癌,鳞癌与腺鳞癌预后无差异。 第二部分:肺腺癌、鳞癌预后相关的共表达差异基因筛选及对腺鳞转分化机制初步探讨 目的: 筛选肺腺癌和肺鳞癌中与预后相关的共表达差异基因,初步分析各基因功能、表达特点及相关性。初步探讨肺腺癌、鳞癌共性基因在腺鳞转分化中作用机制。 方法: 利用TCGA(The Cancer Genome Atlas,癌症基因组图谱)数据库和R语言程序包“GDCRNATools”下载肺腺癌及肺鳞癌的临床数据及RNA-seq-counts/fpkm数据,得到592例肺腺癌样本和551例肺鳞癌样本,其中包括癌组织及癌旁正常组织;采用R语言程序包“DESeq2”进行肿瘤与正常组织的差异表达分析;R语言程序包“survival”分析基因表达量与肿瘤病人预后之间的关系;取两者交集,筛选出与生存相关的差异表达基因;利用String网站对筛选出的基因进行蛋白互作分析,查看基因功能及各基因之间的相关性。 结果: 肺腺癌筛选出308个与预后相关的差异表达基因,肺鳞癌筛选出169个,两者共有17个基因,其中C8B、CLDN18、CLIC5、FCN3、CD300LG、FAM107A、KCNK3、 MCEMP1、KIAA0408、RP1-301L19.1、CTB-43E15.1、RP11-141J13.5、GPIHBP1这13个基因表达量对腺癌和鳞癌的预后作用相反;另外4个基因EREG、LINC00460、XXyac-YM21GA2.4、KCNJ18对腺癌和鳞癌的预后作用相同。编码蛋白质的共12个基因,长链非编码RNA4个(LINC00460,XXyac-YM21GA2.4,CTB-43E15.1,RP11-141J13.5),反义RNA1个(RP1-301L19.1)。将编码蛋白质的12个基因与已经报道的可能参与腺癌和鳞癌不同病理类型相互转化的基因,如STK11、SOX-2、YAP、EGFR,共同输入String查看基因编码蛋白之间的相互作用,只有EREG与已知转化相关基因编码蛋白形成网络,其余基因编码蛋白均未见互作关系点。另外CLIC5、CLDN18、EREG涉及细胞形态发生、细胞分化调节及发育进程监管等生物过程。 结论: 肺腺癌及肺鳞癌存在与预后相关的共表达差异基因,这些基因与预后的相关性在肺腺癌及鳞癌中部分相同,部分相反;并在体内发挥重要的分子功能,参与体内重要的生物过程,其中CLIC5、CLDN18、EREG等可能参与细胞转分化过程,值得我们进一步深入研究,探讨其中可能的腺鳞之间细胞表型转分化机制,为后续细胞实验及动物实验提供理论依据。