在目前公司实践中,股权代持这个特殊现象大量存在,并引发了一系列的纠纷。虽然《最高人民法院关于适用<中华人民共和国公司法>若干问题的规定(三)》(以下简称为《司法解释三》)中对股权代持相关问题给出了相应的规定,但从大量司法案例分析中发现股权代持仍存在诸多问题,比如股东资格的认定、股东权益的归属、股权代持协议的法律性质等问题都存在着模糊之处,致使司法裁判中出现“同案不同判”的现象。因此,本文从实际出资人的权益保护入手,通过对实际出资人股东资格的认定和权益保护途径的分析,提出相应的建议和措施。本文共分三个部分:第一部分是实际出资人权益保护所涉及的基本问题,简要分析股权代持中所涉及各主体之间的关系,并通过对相关案例的分析来说明实际出资人在实践中面临的风险。第二部分从股东资格认定的相关学说入手,通过分析表明对折中说的赞同,但实际出资人股东资格的认定应在现有法律规定的基础上结合其他多方面的因素进行考察;用股权二分论来分析股权代持中财产权和人身权的归属问题,认为股权中财产权应属于实际出资人所有,而人身权则应由名义股东享有,若实际出资人参与到公司的经营管理时,关于股东资格的认定应当结合其他股东的意见来考虑;从股权代持协议的法律性质入手分析实际出资人权益保护的依据,因股权信托制度与股权代持有着天然的相似之处,与其他制度相比有其自身的优势,故认为构建股权信托制度不失为一个保护实际出资人权益的良策。第三部分主要是对实际出资人权益保护提出的建议,首先要完善我国现有的法律制度,区分股权代持协议的效力,规范股东资格的认定,设立事前的风险提示制度;其次从信托法律关系入手,通过对主体、客体、内容三个要素进行分析,将股权纳入到信托财产的范围,构建股权信托制度;最后对实际出资人提出增强风险防范的建议。