本论文通过分析介绍国内外自由港的发展，吸取其成功的经验，并且与南沙（龙穴岛）港区港一体化的建设相结合，从宏观上对南沙（龙穴岛）区港一体化发展规划进行了研究。在配套政策方面也进行了探讨。 论文第一部分包括第一章和第二章，主要介绍了国际上自由港的发展历史和现状，同时结合我国保税区的现状，分析了国内港区互动的现状和存在的主要问题，并就区港一体化进程中这些问题的合理解决方法进行了探讨。 论文第三章至五章对南沙（龙穴岛）区位优势和腹地经济发展状况和内、外贸箱源的比较研究，论证和提出了南沙港区港一体化的必要性和可行性，经过分析论证了区港一体化方案是可行的，同时对区港一体化后的前景进行了展望。而且通过对世界上自由港方案和模式的研究，论证了南沙自由港的选择应该以建立港中自由港的方式进行，待条件成熟之际，推广到全港，建立更大的自由港区。并且对建立区港一体化后的宏观管理政策提出了自己的观点。最后通过对国外成熟的自由港运行和管理机制理论的研究，提出了南沙（龙穴岛）区港一体化后的管理运行机制，通过成立南沙自由港管理股份有限公司，实现对自由港的运作管理，行政管理则由广州市港务局来完成。并且在自由港的功能方面也提出了自己的观点。