向日葵产量相关性状QTL定位及候选基因筛选

来源 :内蒙古农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yellowfly1
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向日葵是全球重要的油料作物和经济作物,提高产量是向日葵育种的主要目标之一。为了深入分析向日葵产量相关性状的分子遗传机制,挖掘有效的分子标记和基因,本研究利用油用向日葵自交系K55和K58为亲本构建的150份向日葵重组自交系群体为研究材料,通过已经构建完成的向日葵SNP分子标记遗传连锁图谱,结合两年重复田间试验获得的表型数据,对株高、盘径、茎粗、叶片数、单盘粒数、单盘空粒数、单盘粒重、百粒重和结实率共9个产量相关的农艺性状进行表型分析、QTL定位分析和候选基因筛选及功能预测。主要研究如下:(1)对RIL群体两年表型数据进行分析,各个株系之间的变异很丰富,变异系数在14.66%~86.58%,变异幅度较大。各个性状之间相关性除单盘空粒数和结实率外均呈极显著或显著正相关,因此除单盘空粒数外,其他8个性状均是决定向日葵籽粒产量的关键因素。聚类分析将供试材料聚为4大类群,包括低产群体37份、中产群体67份、中高产群体41份和高产群体7份。(2)两年环境下共检测到8个性状的10个QTL位点(LOD≧2),包括2个贡献率大于10%的主效QTL和8个微效QTL位点,可解释0.004%~13.075%的表型变异,分布在第4、5、7、8、9、13、14、16、17这9个连锁群上,其他连锁群上未检测到QTL位点。其中,第17连锁群上分布的QTL位点最多(2个),其余连锁群上各检测到1个QTL位点。8个性状的加性效应值绝大部分是正值,即增加性状的表型值的等位基因均是来自母本K55,此外,也存在少量来自父本K58的具有负效应值的等位基因。(3)检测到了茎粗QTL位点Qsd17,位于17号染色体Marker125344-Marker128610内,该区间内还检测到了的单盘粒数的QTL位点Qngp17,贡献率为13.075%,贡献率大于10%,是一个主效QTL位点,且Qsd17、Qngp17和Qhgw5、Qgw16对表型贡献率较其他QTL位点高,适合进一步挖掘候选基因。(4)在Qsd17、Qngp17、Qhgw5和Qgw16四个QTL位点内利用生物信息学方法共发现14个候选基因,1个与茎粗有关,7个与单盘粒数有关,1个与单盘粒重有关,5个与百粒重有关,这些基因参与碳水化合物过程,具有E3泛素蛋白连接酶、SAUR家族蛋白等功能。(5)在候选基因功能注释中发现基因rna55361、rna13297、rna13113可作为后期产量相关基因克隆和功能验证的研究重点。
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