RNA结合蛋白RBM47的抗病毒作用及分子机制的研究

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病毒广泛存在于自然界中,颗粒微小,无完整细胞结构,具有高度的寄生性。病毒必须利用宿主细胞的能量代谢系统和蛋白质翻译系统才能实现自我复制,并不断进化出一系列免疫逃逸机制。宿主在与病毒等病原体的长期“斗争”中,也出现了高度复杂和精细的抗病毒感染的免疫系统,从而及时有效地清除外来病原体。我们的前期试验通过高通量测序筛选发现了 RBM47基因在登革病毒感染的细胞中表达上调。随后,我们又进一步验证了 RBM47在细胞受到多种病毒感染或干扰素刺激后,表达显著上调。RBM47含有两个RNA结合结构域,可以特异性的结合RNA,但不结合单链DNA。最近的研究表明,RBM47是胚胎发育和肿瘤发生过程中RNA转录后调控的关键蛋白,但目前尚没有相关研究报道RBM47在病毒感染的过程中有何作用。我们发现在细胞中过表达RBM47,能够有效抑制RNA病毒VSV、DENV-2、ZIKV和H1N1以及DNA病毒HSV-1的复制。而利用RNA干扰技术使该基因表达下调后,病毒的复制则显著增加。这提示RBM47在细胞中具有抗病毒作用。随后,我们还获得了 RBM47基因敲除的杂合子小鼠,检测发现RBM47缺失的小鼠对VSV和HSV-1病毒感染都更加敏感,这说明RBM47在小鼠体内也具有抗病毒作用。通过双荧光素酶报告基因实验检测到RBM47对病毒刺激的细胞中干扰素的表达没有显著影响,但是对I型干扰素下游活化原件ISRE的激活以及干扰素刺激基因ISGs的表达有显著增强的作用。蛋白-RNA共沉淀结合RNA测序发现,RBM47可以通过结合IFNAR1的mRNA的3’ UTR,增强该mRNA的稳定性,从而增强了细胞在IFN刺激后的抗病毒效应,促进了相关ISGs的正常表达。为了解析RBM47相互作用的蛋白,我们利用免疫沉淀结合质谱分析方法(IP-MS),发现了 PCBP2与RBM47具有相互作用。PCBP2被报道是一个RNA结合蛋白,能够结合并稳定STAT1和STAT2的mRNA,促进ISGs的表达。基于RIP和QPCR分析,我们发现PCBP2可以协同RBM47稳定IFNAR1的mRNA,进而促进了 ISGs的表达,增强了宿主抗病毒反应。本课题首次揭示了 RNA结合蛋白RBM47在增强宿主IFN下游信号通路的活化过程中发挥着重要作用。同时这也是首次发现RBM家族成员在抗病毒天然免疫调控中的作用,为抗病毒药物的研究提供了新的靶点。
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