公路货运业是物流业的基础性业态,个体运输业户是公路货运市场的主体。随着“营改增”在物流业全面推开,个体运输业户在开具增值税发票方面问题更加突出,影响到行业的规范发展和转型升级。本文分析了货物个体运输户“营改增”后出现的问题、产生的原因及其影响。我国以往的增值税发票的管理不能适应公路运输具有特点,导致交通运输业“营改增”后个体运输户提供劳务后不能向购买方提供增值税专用发票。这扰乱了正常的生产经营次序,给纳税人带来了财务风险和税务风险,也产生了税收漏洞,造成了国家税收收入流失,后果极其严重。本文梳理了国外公路运输业增值税的管理经验,结合我国的实际情况,提出个体运输增值税征管优化措施,第一是利用公路运输信息平台、物流园区实现对货物个体运输业务的监控,帮助税务机关核实业务发生的真实性,为货物个体运输户代开发票；第二仿照我国农产品收购发票的模式,由劳务接受方代个体运输户开具增值税专用发票；第三把公路货物个体运输业务的开票权给个体运输车辆,以个体运输车辆作为纳税义务人进行管理。优化措施实施后,可以引导纳税人加强对税收法律的遵从,完善税收政策,堵塞纳税漏洞,现实意义重大。本文利用2012年投入产出表、中国税务年鉴及中国统计年鉴对提出的个体运输增值税征管优化措施实施的影响进行了测算。对比优化措施实施前后,各方的税负变化,结果表明提出的优化措施无论对个体运输劳务提供方和劳务接收方,还是对国家财政收入的影响都是积极。优化措施实施后,物流业的税收负担单位增加值大约降低0.25%-0.64%。