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近年来，随着能源紧缺，国际油价的不断升高，以及环境的恶化，生物柴油作为一种极有发展前景的生物能源，其规模化发展受到了很大的关注。与此同时，生物柴油副产物甘油的产量也日益增多，远大于传统的甘油市场需求。因此，对生物柴油生产过程中低价粗甘油的有效利用成为一个严峻关键的问题。大力开发和利用甘油可以降低生物柴油的制备成本，减少环境污染，提高市场竞争力。许多微生物都可以利用甘油生产有价值的产品，因此微生物转化生物柴油副产物甘油是解决污染、提高生物柴油产业经济效益的途径之一。本研究采用生物柴油副产物甘油为碳源，分别利用培养畸雌腐霉（Pythium irregulare）发酵生产EPA及利用培养裂殖壶菌（S. limacinum）发酵生产DHA，并对发酵工艺进行优化找出较适宜的发酵条件。利用生物柴油副产物甘油为碳源，培养畸雌腐霉（Pythium irregulare）发酵生产EPA，培养裂殖壶菌（S. limacinum）发酵生产DHA。实验中所用废甘油为利用碱法催化大豆油与甲醇进行酯交换反应生成，粗甘油经过纯化精制作为碳源。EPA和DHA产量采用气相色谱分析，分析之前采用浓硫酸-甲醇酯化法进行脂肪酸甲酯化。由实验得出，EPA最佳发酵条件为：温度为25℃，pH为6，转速为170r/min，粗甘油加入量为70g/L，此条件下获得的EPA产量为：105mg/L。DHA最佳发酵条件为：温度为25℃，pH为7，转速为170r/min，粗甘油加入量为75g/L，此条件下获得的DHA产量为：3.5g/L。综上所述，利用生物柴油副产物粗甘油为碳源发酵生产EPA及DHA是可行的。生物柴油副产物粗甘油价格低廉，容易购买，具有良好的应用潜力，有望替代传统碳源，实现工业化生产。