桑树重金属锌胁迫转录组、相关基因的克隆及差异基因的表达分析

来源 :江苏科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tcfan
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
锌(Zn2+)是桑树必需的微量营养素,在生长、发育和防御病虫害侵害中起着关键作用,在酶催化、蛋白质合成、碳水化合物和生长素代谢、能量耗散、环境胁迫耐量等基础生化过程中发挥多种作用,是数百种酶的催化和结构蛋白辅因子,在与其他分子相互作用的蛋白结构域中具有关键的结构功能。锌过量或者缺乏都会对桑树造成不同程度的损伤。本试验以一年生丰驰桑苗为材料,通过不同浓度的锌胁迫条件处理后,进行生理生化相关指标检测及二代转录组测序,从分子机制方面了解丰驰桑的锌代谢,进而为阐明植物高效率吸收利用锌离子的分子机理以及培育锌高效利用的新品种提供分子生物学依据,从分子生物学领域探讨桑树重金属锌胁迫离子通道相关基因的克隆及分析,结合运用RT-PCR、基因组测序等分子生物技术,获得锌胁迫相关的两个类黄酮基因c DNA全长序列,并对其进行生物信息学分析,旨在提高丰驰桑的锌肥利用效率,保持生态环境的可持续发展。主要研究内容及结果如下:1.丰驰桑锌胁迫的生理生化指标测定:在不同浓度锌的胁迫下,所检测的丰驰桑生理指标有:超氧化物歧化酶(SOD)、丙二醛(MDA)、脯氨酸(Pro)、叶绿素(Chlorophyll),结果显示在不同部位中都有不同程度的随胁迫浓度增加而上升,而超过丰驰桑耐受值后出现下降的趋势。在锌胁迫下,植物蛋白含量、抗氧化能力、抗毒性作用以及生长状况均有不同程度下降。这为更多植物在非生物胁迫下生理生化指标研究提供了一定的参考依据。2.丰驰桑转录组测序初步分析及差异基因的鉴定:从高通量测序实验中共得到58397个差异基因,其中35991个基因被注释到NR数据库中,22359个基因被注释到Swissprot数据库中,20092个基因被注释到KOG数据库中,13689个基因被注释到KEGG数据库中。基于结果,进行可变剪接预测分析、基因结构优化分析以及新基因的发掘,并进行基因表达量分析。根据基因在不同样品中的表达量来识别差异表达基因,并对其进行功能注释和富集分析。选上下调基因,进行相对表达量的检测分析。其结果与预测相吻合,基因的表达量也与前期实验结果相对应。为后续桑树在锌胁迫下的基因研究奠定了基础。3.丰驰桑MalFLS基因的克隆、序列分析及表达分析:在丰驰桑中克隆得到MalFLS基因,该基因序列长度为1077 bp,其中含有1008 bp开放性ORF区域(起始密码子ATG,终止密码子TAA),该基因含有335个氨基酸编码,预测该基因蛋白质分子质量理论Mw为38.18 k D,等电点理论PI为5.55,属于20G-Fe II_0xy超家族一员。4.丰驰桑MalCHS基因的克隆、序列分析及表达分析:在丰驰桑中克隆得到MalCHS基因,该基因序列长度为1258 bp,其中含有1176 bp开放性ORF区域(起始密码子ATG,终止密码子TAA),该基因含有389个氨基酸编码,预测该基因蛋白质分子质量理论Mw为42.83 k D,等电点理论PI为6.48,属于fab H超家族的一员。
其他文献
随着中国经济的快速发展以及国际交流的不断扩大,我国的铁路车站建设进入了一个全新的发展时期。国家在《中长期铁路网规划》指出“到2020年,全国铁路营业里程达到12万公里以上。同时开工建设铁路新车站1000余座,建成804座。”沈阳铁路局作为规划的实施单位之一,管辖范围内需要建设很多铁路车站,而其中中小型车站就占了规划的70%以上。因此,本论文对沈阳铁路局管辖范围内中小型铁路车站设计研究具有重要意义。
糯米由于其独特的结构和消化特性,导致其市场价值的提升受到限制。目前国内外对于稻米品质和稻米淀粉的研究主要集中在非糯稻上,对发芽糯稻,特别是对不同发芽阶段的糙米粉及其淀粉的研究较少。因此,本文将糙糯米发芽0、12、24、36、48、72小时,并研究不同发芽时间对糙糯米粉及其淀粉结构和物化性质的影响,分析发芽过程中糯糙米的结构和物化性质的改善,在保证其丰富营养的基础上,研究糙糯米的食用品质,为糙糯米的
玉米是我国三大粮食作物之一,其生长影响我国国民经济的发展。随着全球土壤盐渍化形势不断加剧,我国盐渍土地总面积超过20万平方公里,大面积的土壤盐渍化已经成为我国农业发展的主要制约因素之一。玉米属于盐敏感作物,与盐渍土壤改良相比,培育耐盐品种是一种更经济更容易实现的方法。开展玉米耐盐基因挖掘,不仅有助于理解玉米对盐胁迫响应的分子机制,更能为培育耐盐玉米品种提供基因资源。本研究以由耐盐性差异明显的两个自
在民事诉讼司法实务中,瑕疵证据大量地出现在法官的视野之中,判决书中也经常会有关于瑕疵证据的表述。但我国法律对瑕疵证据并没有明确的规定,理论界虽有一定研究但还并不充分,实务中法官对于瑕疵证据的理解和适用并不统一,有时甚至会因此而作出错误的判定。本文拟对民事瑕疵证据的内涵进行概述,并重点分析其基本原理和适用规则。本文主要分为四个部分:第一部分是瑕疵证据的界定,首先进行了实证研究,列举了司法实务中瑕疵证
词汇的情感评定是对词汇在效价、唤醒、优势度等三个维度上的情感感知测量。这种评定可用于判断词汇的情感维度是否会影响词汇加工。目前,语言学、心理学、认知科学等领域的
超大型城市是我国城市化进入新阶段的产物,推进超大型城市治理现代化是推进我国城市治理体系和治理能力现代化的必然要求。全周期管理理念是习近平总书记为超大型城市应对风
目的本课题研究OCTA对不同分期的DR患者视网膜微血管结构进行检查,建立三维图像,分析图像,输出量化后的各种参数,分析影响DR进展的因素与糖尿病视网膜病变的分期之间的相关性;分析DR各期视网膜微血管的形态特征及微循环的血流情况。研究各参数在DR的不同阶段的特征,分为DR的早期诊断及分期提供依据。方法本研究纳入糖尿病患者是经过内分泌科医生根据血糖水平诊断为糖尿病的患者,经过眼科专科检查和血液学标本检
本文以克丽斯塔·沃尔夫的作品《卡珊德拉》为例,探寻了身份与家园之间的内在关联。个人身份和人格的塑造往往是动态的过程,由自我的构建和解构组成,且这两者是紧密相连的。卡珊德拉作为最古老的希腊神话人物之一,在历史中具有其独特的重要性,但只有在沃尔夫的作品中才被赋予了崭新的视角和诠释。卡珊德拉是特洛伊国王普里阿莫斯的女儿,同时也是帕里斯—特洛伊战争的挑起者—的姐妹。帕里斯因为爱上了希腊国王墨涅拉俄斯的妻子
随着我国经济快速发展,快速的城市化带来的区域生态环境变化,尤其是热环境变化,已经对区域生态环境造成重大影响。喀斯特地区生态脆弱且难以在短时间内恢复,在区域城市化速度不断加快的背景下,研究城市化对区域热环境的影响对区域可持续发展有着重要的意义。本文以贵阳市及其周边地区为研究区,利用Landsat影像数据提取研究区土地覆盖变化特征,结合MOD11A2地表温度数据和研究区特殊的喀斯特地质地貌特征,通过对
高等教育处于教育体系的顶端,其培养出来的大学毕业生是我国参与科技竞争、建设人才强国的重要力量,也是我国走创新驱动发展之路、实现创新强国的重要支撑。高校毕业生就业地区的选择将直接影响人才流动和地区发展。伴随我国高校扩大招生而来的是日益增加的毕业生人数,屡创新高值的毕业生大军加剧了就业市场的严峻形势。面对不断收紧的毕业生落户政策和高门槛的人才引进政策,对在北京地区高校就读的京外户籍大学生来说,毕业后是