小麦条锈病是影响我国小麦生产安全最为严重的病害之一,由条形柄锈菌小麦专化型(Puccinia striiformis f.sp.tritici)引起。我国具有独立完整的小麦条锈病流行体系,病原菌可在不同地方越夏、越冬,靠气流进行远距离传播并造成病害春季流行。众多的研究结果表明,甘肃陇南和川西北地区是我国小麦条锈菌最为重要的秋季菌源基地以及新小种产生的策源地,为我国广大麦区秋季发病提供菌源。然而,2017年我国小麦条锈病发生流行却表现出了不同以往的特征,在菌源基地菌源数量较少情况下,小麦条锈病发生偏重流行,其原因有待深入研究揭示。本项研究旨在基于2017年病害发生情况,利用分子遗传学手段,研究不同区域条锈菌群体的遗传多样性及其区间菌源关系,分析2017年小麦条锈病发生流行的主要菌源因素。运用微卫星分子标记和分子遗传学方法,对2017年和2018年来源于云南、贵州、四川、甘肃、陕西、山西、湖北、安徽等8个省份的770份小麦条锈病标样进行了群体遗传学分析。具体结果如下:1.初步查明了我国8个省份的小麦条锈菌群体遗传多样性:发现甘肃地区条锈菌群体遗传多样性最高,湖北地区条锈菌群体遗传多样性最低,云南、贵州和四川地区条锈菌群体遗传多样性较为一致,其中四川群体略高。陕西地区条锈菌群体遗传多样性仅次于甘肃地区,山西地区条锈菌群体同样具有较高的遗传多样性。安徽地区的条锈菌群体尽管具有较高的基因型多样性,但其基因多样性较低,仅高于湖北地区。2.连锁不平衡分析表明,整体上我国小麦条锈菌群体表现出无性繁殖特征,其中甘肃群体具有与其他地区不同的特征,虽不属于完全连锁平衡状态,但表现出一定程度的有性生殖特点,其有性生殖比例及其对病害发生流行的作用还需进一步研究。3.对来自8个省份的条锈菌群体的分子方差分析(AMOVA)结果表明,大部分的变异来源于条锈菌内部,不同地区间的条锈菌群体具有极显著差异(P=0.001)。4.基于nei’s遗传距离绘制的聚类图在0.03的差异上,将12个群体分为两大类群,其中甘肃、陕西、四川以及山西的条锈菌群体聚为一类;云南、贵州、湖北以及安徽的条锈菌群体聚为另一类。5.根据不同地区小麦条锈菌群体的共享基因型、遗传相似度以及MSN分析结果表明,湖北、安徽地区条锈菌群体与云南、贵州地区条锈菌群体更为相似,推测2017年度我国小麦条锈病发生流行的菌源可能来自云南-贵州地区。6.揭示了云贵川小麦条锈菌存在广泛的菌源交流,其中云贵地区更为强烈。同时,甘肃与四川的条锈菌群体之间同样存在菌源交流,推测四川地区可能为甘肃与云南-贵州地区菌源交流起着中转作用。