在社会经济转型发展的新时期,创新作为推动社会进步发展的重要驱动力,是企业在市场竞争中保持核心竞争力的关键因素。受资源局限和成本因素的限制,在企业创新过程中,寻求外部创新合作是有效解决资源短缺和控制成本的重要方式。与此同时,基于科学的创新区别于传统基于技术的创新,前者包含更深的理论基础,更有利于科学知识的吸收和科学知识网络的构建。基于此,如何从基于科学创新的视角中探究产学研合作模式对企业创新的影响效用及作用机制,从而有效促进企业科学创新至关重要。文章通过国泰安数据库（CSMAR）、国家知识产权局（SIPO）专利检索网和巨潮资讯网等,搜集了112家生物医药类A股主板上市公司2010年—2018年相关数据为研究样本,其中包括产学研合作特征数据、企业专利数据和企业相关财务数据等。基于科学的视角,构建产学研合作、合作创新的科学性程度、企业创新绩效等主要变量。通过对相关文献的阅读和整理,并结合资源基础理论、知识基础理论和协同创新理论等,进一步提出相应的研究假设,并构建回归模型。最后利用STATA14.0分别对提出的研究假设进行实证检验。验证产学研合作与合作创新的科学性程度分别对企业创新绩效的影响,以及在基于科学的创新影响下产学研合作对企业创新绩效影响效用的变化。研究结果显示,产学研合作模式与合作创新的科学性程度都对企业创新绩效呈正向影响;另外,在基于科学创新的影响下,合作创新的科学性程度对产学研合作模式与企业创新绩效的影响变化不大,起到部分中介的作用。根据上述结论,本文认为创新成果的转化依赖于产学研合作,产学研合作正向影响企业创新数量和质量。然而,合作创新的科学性程度的效应程度低于预期。这意味着在实际的创新过程中,科学知识的有效转化程度低,高校和科研机构的参与还不足,合作创新的科学性程度还有待提高。这一结果无疑对产学研合作创新的研究具有重要的启发意义。研究结果从科学的视角探究产学研合作模式与企业创新绩效关系的影响变化及机制作用,不仅有利于厘清产学研合作对企业创新绩效的影响机制及相关效应,而且对丰富和发展基于科学创新的产学研合作创新研究有较高的实践价值和理论意义。