中国散发性先天性心脏病人群稀有变异的研究

来源 :上海交通大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhangtao707382332
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
先天性心脏病(简称先心病)是一种由于胎儿心脏发育异常而导致心血管结构畸形的复杂性疾病,在我国有较高的发病率,给患者和社会造成了沉重的负担。为了研究中国散发性先心病的遗传因素,我们综合了多种先进的遗传学手段和方法(包括基因芯片,第二代测序技术等)对中国散发性先心病人群的稀有变异进行了检测。我们将66名不同临床亚型的先心病患者分为4组,将每组患者的基因组DNA等量混合后,分别进行外显子组测序。对测序数据进行分析及验证后,我们一共发现了843个变异,我们又在800名正常人中检测是否存在上述变异,而只保留正常人群中不存在的变异,结果我们在散发性先心病人群中识别了387个稀有变异,其中包括351个错义突变,14个剪接位点突变以及22个无义突变。在此基础上我们挑选了一系列的候选基因,在217名散发性先心病患者中对它们的编码区进行测序,并排除在正常人群也存在的变异,最终我们在PKD1L1基因中发现了19个稀有变异(P=9.434e-14),在DLC1基因中发现了11个稀有变异(P=1.208e-8),在FAM71A基因中发现了6个稀有变异(P=8.932e-5)。我们还分析了400名正常人的外显子组测序数据,在PKD1L1基因中只发现了4个稀有变异,这说明相对于正常人群,PKD1L1基因的稀有变异显著地富集在散发性先心病人群中(P=2.736e-6)。此外,SIFT软件的预测结果表明,PKD1L1基因的19个稀有变异在平均水平上会对蛋白的结构或功能造成影响(P<0.001)。另一方面,我们利用基因芯片技术对58名先心病患者进行了全基因组扫描,发现了一些稀有的拷贝数变异。我们首次在中国散发性先心病人群中进行了外显子组测序,识别了多个先心病人群特异的稀有变异,建立了中国散发性先心病人群的稀有变异图谱,更为重要的是,我们发现PKD1L1基因的稀有变异与先心病的发生有密切关系,这些为对中国散发性先心病遗传因素的后续研究打下了坚实的基础。
其他文献
刘森创作演奏的笛曲都带有很明显的歌唱性风格,这种风格不仅仅是简单地把歌唱的感觉"转移到"笛子演奏中来,而且还相应的开创出了一些独特的演奏技巧来配合"歌唱性"风格的表达
道德伪善(moral hypocrisy)是对道德知行脱离进行反思的产物,反映了道德心理学和社会认知领域的最新进展。从社会学习理论、认知失调理论、社会影响理论和双加工理论四个理论
<正>为方便广大读者学习,本刊编辑部全面解读、梳理十九大报告中出现的四十个新提法、新举措。01中国共产党人的初心和使命十九大报告提出,中国共产党人的初心和使命,就是为
在学理和比较法上,广泛意义上的阴阳合同为通谋虚伪表示是比较明确的。但是因为我国合同法中并没有通谋虚伪表示这种情形,所以在我国现在的合同效力体系内如何认定建筑工程阴
在现代市场经济中文化与经济共生互动 ,文化经济化的趋势日趋明显。本文探讨的是这一现象存在的客观现实性以及未来前景。作为这一领域中的特殊产品 ,文化商品以其特殊性不断
目的探讨"知信行"模式对提高局部晚期宫颈癌(LACC)患者放疗后阴道冲洗依从性的效果。方法选取2016年1月—2017年12月收治的LACC患者120例,患者随机分为观察组和对照组,各60例
学生是生活中的人,脱离生活的教育是无视学生的教育,高中思想政治课教学回归生活亦是大势所趋。只有使课堂教学和现实生活有机结合起来,才能彰显高中思想政治课课堂教学的生
低温等离子体技术是一种快速简便、高效无污染的材料表面处理工艺,符合现代清洁和绿色环保的理念,其在纸浆纤维表面处理中的应用日益引人注目。本论文利用空气辉光放电低温等
目的分析不同工龄噪声作业人员健康检查结果,探讨噪声作业工人工龄与高压高频听力损失的关系。方法对北京市怀柔辖区内1 630名工龄在1~20年的噪声作业人员按照《职业健康监护
随着国民经济水平的快速发展,电能作为一项重要的产能推动着整体经济的增长,而城市的发展和人们的生活也越来越离不开电力。在科技信息自动化的技术推广应用日益普及的时代,